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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 用QPCR验证RNA-seq结果的可靠性，至少要几个基因？
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Kenmin

银虫 (初入文坛)

[求助] 用QPCR验证RNA-seq结果的可靠性，至少要几个基因？ 已有1人参与

假设QPCR做了10个基因，其中有8个和RNA-seq的结果一致，是否能够直接说明RNA-seq结果是可靠的呢？
主要是想知道QPCR验证结果至少要多少个基因和RNA-seq的结果一致才算有说服力？
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转录组测序 RNA-seq

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1楼 2015-08-24 23:15:25
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Kenmin

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xiaodi1989 at 2015-08-27 03:57:39
RNAseq要做2个重复，如果相关系数高，只需要验证你关心的基因就行了

当时RNA-seq做的是混池，没有重复，这种情况下，验证多少基因比较合适？
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4楼2015-08-27 07:58:59
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xiaodi1989

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
Kenmin: 金币+10, ★有帮助 2015-08-27 08:05:17
RNAseq要做2个重复，如果相关系数高，只需要验证你关心的基因就行了
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2楼2015-08-27 03:57:39
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snss1983

木虫 (正式写手)
看你要发的杂志了。一般的验证20左右足够了。好一点的选择都用miseq验证了。这个数量在100多个。

[ 发自小木虫客户端 ]
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3楼2015-08-27 07:33:03
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