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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
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Kenmin

银虫 (初入文坛)

[求助] 用QPCR验证RNA-seq结果的可靠性,至少要几个基因?已有1人参与

假设QPCR做了10个基因,其中有8个和RNA-seq的结果一致,是否能够直接说明RNA-seq结果是可靠的呢?
主要是想知道QPCR验证结果至少要多少个基因和RNA-seq的结果一致才算有说服力?
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xiaodi1989

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
Kenmin: 金币+10, 有帮助 2015-08-27 08:05:17
RNAseq要做2个重复,如果相关系数高,只需要验证你关心的基因就行了
2楼2015-08-27 03:57:39
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snss1983

木虫 (正式写手)

看你要发的杂志了。一般的验证20左右足够了。好一点的选择都用miseq验证了。这个数量在100多个。

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2015-08-27 07:33:03
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Kenmin

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xiaodi1989 at 2015-08-27 03:57:39
RNAseq要做2个重复,如果相关系数高,只需要验证你关心的基因就行了

当时RNA-seq做的是混池,没有重复,这种情况下,验证多少基因比较合适?
4楼2015-08-27 07:58:59
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