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为什么我要表达的eIF4GI基因序列是3920bp，但是只表达1305个氨基酸呢 已有1人参与
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| 急求急求，跪求跪求。。。。我要表达鸭子的eIF4GI做抗体，NCBI上发布的eIF4G的编码区有3920bp，但是只编码1305个氨基酸，编码区基因刚开始3位是起始密码子，最后三位是终止密码子，请问这是为什么呢，首先编码区基因序列根本不是3的倍数，其次正常的话是编码1305个氨基酸，余下2bp。为什么呢？ |
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【答案】应助回帖
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蛇精病范: 金币+5 2015-08-26 15:59:44
蛇精病范: 金币+5 2015-08-26 15:59:44
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EIF4G1 eukaryotic translation initiation factor 4 gamma, 1 [ Anas platyrhynchos (mallard) ] Gene ID: 101791993, updated on 11-Jul-2015 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=101791993 mRNA序列：3918bp，N表示A/T/C/G四种碱基的其中一种 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/XM_013102310.1 蛋白序列：1305aa X表示未知氨基酸或终止密码子 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/XP_012957764.1 这个序列是基因枪测序的数据，这个EIF4G1蛋白是由软件预测，product="LOW QUALITY PROTEIN: eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1"，注意前面这个LOW QUALITY PROTEIN，说明这个基因的数据不太准确 具体到你做实验，可以先提RNA进行逆转录，获得绿头鸭的cDNA，根据已公布的mRNA序列的上下游设计引物，扩增出cDNA样本中的EIF4G1基因的开放阅读框，然后测通，获得全长，就知道了你实验标本绿头鸭EI4G1基因编码区的准确序列，然后根据实验需要，往下继续进行。 gene 1..3918 /gene="EIF4G1" /note="The sequence of the model RefSeq transcript was modified relative to its source genomic sequence to represent the inferred CDS: deleted 2 bases in 1 codon; Derived by automated computational analysis using gene prediction method: Gnomon. Supporting evidence includes similarity to: 1 Protein, and 93% coverage of the annotated genomic feature by RNAseq alignments" /db_xref="GeneID:101791993" CDS 1..3918 /gene="EIF4G1" /note="The sequence of the model RefSeq protein was modified relative to its source genomic sequence to represent the inferred CDS: deleted 2 bases in 1 codon; substituted 1 base at 1 genomic stop codon" /codon_start=1 /transl_except=(pos:1030..1032,aa:OTHER) /product="LOW QUALITY PROTEIN: eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1" /protein_id="XP_012957764.1" /db_xref="GI:874481792" /db_xref="GeneID:101791993" |
8楼2015-08-26 10:19:26
2楼2015-08-25 04:46:25
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4楼2015-08-25 10:36:03
