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reachsea

木虫 (正式写手)

小木虫末席科学家

[求助] mdrun -c file.pbd 已有1人参与

请问mdrun -s file1.tpr -o traj. trr -c file.pdb
中 的 -c file.pdb 是什么作用? file.pdb是input还是output?  我用mdrun -h 想查一下,但是显示不了,而其他命令的帮助信息可以查到,例如grompp -h是有帮助信息的。
google了一番,也没有查到mdrun 的帮助信息,特来小木虫论坛请教大侠!谢谢各位!
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以学术为业。
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reachsea

木虫 (正式写手)

小木虫末席科学家

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by jerkwin at 2015-08-21 20:52:28
是输入文件,
参见http://jerkwin.github.io/9999/12/01/GROMACS%E7%A8%8B%E5%BA%8F%E6%96%87%E6%A1%A3/

是输出结构文件(-c)包含了最后一步的坐标和速度。 谢谢这个链接,很有帮助。
以学术为业。
3楼2015-08-22 16:58:58
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2015-08-21 20:52:28
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