| 查看: 1003 | 回复: 9 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
xufund至尊木虫 (知名作家)
|
[交流]
［求助］运行sybyl 中dock模块的问题
|
||
|
我按照网上的方法在ubuntu8.04中安装了SYBYL（装了install dvd和bookshelf，dvd2不知该如何安装，网友们也只说安装前两张）。现在能够正常使用的是画结构和能量优化模块。最近按照说明书学习单分子DOCK时，在Options 选项中进入 FlexX，如果采用默认配置（Input 选项中Config file 默认为//tables/default.dat），点击 Transform Details时出现错误提示“You must specify a valid existing config file to proceed“。 如果不运行Transform Details，按照说明继续往下，则在最后运行dock时提示“unable to open //tables/default.dat“。我检查了tables目录，里面确实是空的。 如果在Options 选项中进入 FlexX后，将Input 选项中Config file 改为为//2ctc_lig.mol2(在前面步骤中生成的配体分子)，点击Transform Details不再报错。但是在最后运行dock时，却提示: “unable to create the active site file and /or the protein single_site.pdb single_prot.pdb“ 终端则提示“Command not found“ 请问是我哪里出错了？该如何解决？谢谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
瑞典林雪平大学博士后招聘｜PEC Water Splitting 方向
已经有130人回复
-
PRB投稿，Acknowledgment sent to author状态十天了
已经有3人回复
-
物理学I论文润色/翻译怎么收费?
已经有56人回复
-
PVA溶解
已经有2人回复
-
基金申请
已经有44人回复
-
CSC与新西兰维多利亚大学PhD奖学金项目
已经有0人回复
-
新西兰Robinson研究所 招聘CSC公派访问人员
已经有0人回复
-
帮我的英语口语老师找学生
已经有0人回复
-
什么时候开奖？
已经有6人回复
-
散金币祈福
已经有38人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
2楼2008-08-25 21:24:01
xufund
至尊木虫 (知名作家)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 18237.5
- 散金: 20
- 红花: 5
- 帖子: 6734
- 在线: 811.7小时
- 虫号: 311488
- 注册: 2006-12-30
- 专业: 合成药物化学
3楼2008-08-26 14:49:34
4楼2008-08-28 08:17:31
5楼2008-08-28 10:05:52
xufund
至尊木虫 (知名作家)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 18237.5
- 散金: 20
- 红花: 5
- 帖子: 6734
- 在线: 811.7小时
- 虫号: 311488
- 注册: 2006-12-30
- 专业: 合成药物化学
6楼2008-08-30 09:59:26
7楼2008-08-30 11:51:43
xufund
至尊木虫 (知名作家)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 18237.5
- 散金: 20
- 红花: 5
- 帖子: 6734
- 在线: 811.7小时
- 虫号: 311488
- 注册: 2006-12-30
- 专业: 合成药物化学
8楼2008-08-30 17:09:18
0342402
木虫 (小有名气)
- 应助: 24 (小学生)
- 金币: 2611.1
- 红花: 2
- 帖子: 273
- 在线: 158.9小时
- 虫号: 383364
- 注册: 2007-05-26
- 专业: 合成药物化学
9楼2008-08-30 21:04:09
xufund
至尊木虫 (知名作家)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 18237.5
- 散金: 20
- 红花: 5
- 帖子: 6734
- 在线: 811.7小时
- 虫号: 311488
- 注册: 2006-12-30
- 专业: 合成药物化学
10楼2008-08-31 17:26:10
