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xufund至尊木虫 (知名作家)
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［求助］运行sybyl 中dock模块的问题
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我按照网上的方法在ubuntu8.04中安装了SYBYL（装了install dvd和bookshelf，dvd2不知该如何安装，网友们也只说安装前两张）。现在能够正常使用的是画结构和能量优化模块。最近按照说明书学习单分子DOCK时，在Options 选项中进入 FlexX，如果采用默认配置（Input 选项中Config file 默认为//tables/default.dat），点击 Transform Details时出现错误提示“You must specify a valid existing config file to proceed“。 如果不运行Transform Details，按照说明继续往下，则在最后运行dock时提示“unable to open //tables/default.dat“。我检查了tables目录，里面确实是空的。 如果在Options 选项中进入 FlexX后，将Input 选项中Config file 改为为//2ctc_lig.mol2(在前面步骤中生成的配体分子)，点击Transform Details不再报错。但是在最后运行dock时，却提示: “unable to create the active site file and /or the protein single_site.pdb single_prot.pdb“ 终端则提示“Command not found“ 请问是我哪里出错了？该如何解决？谢谢！ |
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