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snzydong

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 求助测序

我最近做一个载体,测序结果回来了,是用的扩片段的引物测的,片段大小1000bp ,测序结果差不多大,但是比对发现前390bp完全一致,但之后就不知道是什么东西了,很不一致。请教高手解答。后面测序的图也很单一很好,不像是测序出了问题。我是在生工测的
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jasco

木虫 (正式写手)

如果测序峰图是好的,那就是克隆的问题了
3楼2008-08-18 17:12:12
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liuyan6817

那就是你的片段有问题
2楼2008-08-18 17:00:39
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chysx6

铁杆木虫 (小有名气)

★ ★ ★
xyklmu(金币+3,VIP+0):感谢答复,积极交流奖
片段大小1000bp话,测序应该用两条引物吧
是不是你其中一个引物出了问题

如果只是用一个引物的话,那700后只做参考

如果测序图后部分确实杂乱无章,可能是污染了杂DNA,
当然还有就是你的片段确实出了问题,为什么出问题,出了什么问题就要看楼主是如何构建的了,可以说出来让大家帮着分析一下
4楼2008-08-18 18:17:06
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康成老陈


xyklmu(金币+1,VIP+0):感谢答复
楼主是双向测的吗?双向测的话一般是左右两端100bp左右的序列会出现不准确的问题.
5楼2008-08-20 09:57:33
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