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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 求助测序
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snzydong

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 求助测序

我最近做一个载体，测序结果回来了，是用的扩片段的引物测的，片段大小1000bp ，测序结果差不多大，但是比对发现前390bp完全一致，但之后就不知道是什么东西了，很不一致。请教高手解答。后面测序的图也很单一很好，不像是测序出了问题。我是在生工测的
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1楼 2008-08-18 16:57:44
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liuyan6817

那就是你的片段有问题
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2楼2008-08-18 17:00:39
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jasco

木虫 (正式写手)
如果测序峰图是好的，那就是克隆的问题了
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3楼2008-08-18 17:12:12
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chysx6

铁杆木虫 (小有名气)
★ ★ ★
xyklmu(金币+3,VIP+0):感谢答复，积极交流奖
片段大小1000bp话，测序应该用两条引物吧
是不是你其中一个引物出了问题

如果只是用一个引物的话，那700后只做参考

如果测序图后部分确实杂乱无章，可能是污染了杂DNA，
当然还有就是你的片段确实出了问题，为什么出问题，出了什么问题就要看楼主是如何构建的了，可以说出来让大家帮着分析一下
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4楼2008-08-18 18:17:06
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康成老陈

★
xyklmu(金币+1,VIP+0):感谢答复
楼主是双向测的吗?双向测的话一般是左右两端100bp左右的序列会出现不准确的问题.
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5楼2008-08-20 09:57:33
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snzydong

铁杆木虫 (著名写手)
单向测一个反应 峰图很好
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6楼2008-08-22 11:12:34
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