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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 请问怎么对iTRAQ得到的蛋白组数据进行功能聚类
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childchou

银虫 (小有名气)

[求助] 请问怎么对iTRAQ得到的蛋白组数据进行功能聚类 已有3人参与

做iTRAQ后得到蛋白组数据，选取表达变化倍数为1.5，后得到300多个蛋白，想请问下怎么把这些蛋白数据进行功能分类，比如分为energy and metabolism，protein kinase，antioxidant enzyme等等这种。本人新手，不太懂，做的是植物的，比较蛋白组分析。
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boomshakalaka
1楼 2015-08-11 19:33:44
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小小逍遥人

金虫 (正式写手)

张斌猪
iTRAQ是你们自己做的还是给公司做的呢  如果是给公司的话他们会帮你分析的
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生命还需要奇迹来衬托
2楼2015-08-12 11:42:36
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childchou

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 小小逍遥人 at 2015-08-12 11:42:36
iTRAQ是你们自己做的还是给公司做的呢  如果是给公司的话他们会帮你分析的

额，自己做的，我有看过别人公司做的，给的那个报告，里面好像没有啊
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boomshakalaka
3楼2015-08-12 15:30:40
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A宝儿

新虫 (初入文坛)
你现在数据分析的怎么样啦？我也是做植物的，送公司测了一堆数据，不懂怎么分析，能不能交流交流？

发自小木虫Android客户端
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4楼2015-10-07 11:33:15
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life_is_life

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
childchou: 金币+3, ★有帮助 2015-11-01 09:54:46
引用回帖:
4楼: Originally posted by A宝儿 at 2015-10-07 11:33:15
你现在数据分析的怎么样啦？我也是做植物的，送公司测了一堆数据，不懂怎么分析，能不能交流交流？

送给公司做，一般都有数据分析呀，主要就是GO功能注释，PATHWAY分析，聚类分析。每种都有软件可以做的，不过自己做的确是挺麻烦的。
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5楼2015-10-29 08:58:48
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天蝎bobo

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 小小逍遥人 at 2015-08-12 11:42:36
iTRAQ是你们自己做的还是给公司做的呢  如果是给公司的话他们会帮你分析的

想请教一下，如果找公司做，他提供了GO分析 COG分析 pathway分析 GO富集分析 pathway富集分析 聚类分析这些分析结果，那么我还需要做什么呢？我是不是就不用再进行数据库分析，直接选几个我想要的差异蛋白做WB验证就好啦？菜鸟啥也不懂，请教大神啊
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6楼2015-11-08 16:46:22
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馒头爱生物

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

建议找家靠谱公司，让技术人员对你的问题具体分析，手把手教你，这样效率高。自己做，弯路太多
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7楼2015-11-18 16:10:45
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洋葱哥哥

木虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 天蝎bobo at 2015-11-08 16:46:22
想请教一下，如果找公司做，他提供了GO分析 COG分析 pathway分析 GO富集分析 pathway富集分析 聚类分析这些分析结果，那么我还需要做什么呢？我是不是就不用再进行数据库分析，直接选几个我想要的差异蛋白做WB验证 ...

公司给做，大概得需要多少钱呢？多长时间
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8楼2015-11-27 16:10:27
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mao081312

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

iTARQ目前包分析打包价大约为七八千每样
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9楼2016-01-31 15:50:43
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