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childchou

银虫 (小有名气)

[求助] 请问怎么对iTRAQ得到的蛋白组数据进行功能聚类 已有3人参与

做iTRAQ后得到蛋白组数据,选取表达变化倍数为1.5,后得到300多个蛋白,想请问下怎么把这些蛋白数据进行功能分类,比如分为energy and metabolism,protein kinase,antioxidant enzyme等等这种。本人新手,不太懂,做的是植物的,比较蛋白组分析。
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boomshakalaka
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小小逍遥人

金虫 (正式写手)

张斌猪

iTRAQ是你们自己做的还是给公司做的呢  如果是给公司的话他们会帮你分析的
生命还需要奇迹来衬托
2楼2015-08-12 11:42:36
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childchou

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 小小逍遥人 at 2015-08-12 11:42:36
iTRAQ是你们自己做的还是给公司做的呢  如果是给公司的话他们会帮你分析的

额,自己做的,我有看过别人公司做的,给的那个报告,里面好像没有啊
boomshakalaka
3楼2015-08-12 15:30:40
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A宝儿

新虫 (初入文坛)

你现在数据分析的怎么样啦?我也是做植物的,送公司测了一堆数据,不懂怎么分析,能不能交流交流?

发自小木虫Android客户端
4楼2015-10-07 11:33:15
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life_is_life

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
childchou: 金币+3, 有帮助 2015-11-01 09:54:46
引用回帖:
4楼: Originally posted by A宝儿 at 2015-10-07 11:33:15
你现在数据分析的怎么样啦?我也是做植物的,送公司测了一堆数据,不懂怎么分析,能不能交流交流?

送给公司做,一般都有数据分析呀,主要就是GO功能注释,PATHWAY分析,聚类分析。每种都有软件可以做的,不过自己做的确是挺麻烦的。
5楼2015-10-29 08:58:48
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天蝎bobo

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 小小逍遥人 at 2015-08-12 11:42:36
iTRAQ是你们自己做的还是给公司做的呢  如果是给公司的话他们会帮你分析的

想请教一下,如果找公司做,他提供了GO分析 COG分析 pathway分析 GO富集分析 pathway富集分析 聚类分析这些分析结果,那么我还需要做什么呢?我是不是就不用再进行数据库分析,直接选几个我想要的差异蛋白做WB验证就好啦?菜鸟啥也不懂,请教大神啊
6楼2015-11-08 16:46:22
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馒头爱生物

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

建议找家靠谱公司,让技术人员对你的问题具体分析,手把手教你,这样效率高。自己做,弯路太多
7楼2015-11-18 16:10:45
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洋葱哥哥

木虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 天蝎bobo at 2015-11-08 16:46:22
想请教一下,如果找公司做,他提供了GO分析 COG分析 pathway分析 GO富集分析 pathway富集分析 聚类分析这些分析结果,那么我还需要做什么呢?我是不是就不用再进行数据库分析,直接选几个我想要的差异蛋白做WB验证 ...

公司给做,大概得需要多少钱呢?多长时间
8楼2015-11-27 16:10:27
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mao081312

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

iTARQ目前包分析打包价大约为七八千每样
9楼2016-01-31 15:50:43
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