| 查看: 1101 | 回复: 4 | |||
[交流]
转录因子 已有2人参与
|
| 本人并非生物学出身，对转录因子不是很了解，现在看文献时有一个疑惑。作者实验用转录组测序方法证实响应细胞外营养元素A缺乏的若干上调基因是由转录因子B调控的，而A缺乏条件下转录因子B的基因表达量没有发生改变。请问转录因子B可能是怎样调控这些基因表达的呢（这个在文献中并没有提到过）？谢谢 |
回复此楼» 猜你喜欢
HILIC磁珠研究蛋白组学怎么做？
已经有0人回复
-
His标签蛋白纯化怎么才能快？
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有131人回复
-
WRN变构抑制剂HRO761：从D1/D2界面锁定到MSI合成致死的工具化合物深度解析
已经有0人回复
-
KRAS G12V(ON) 选择性抑制剂 RMC-5127：从三元复合物机制到科研应用
已经有0人回复
-
SHP2 变构抑制剂 Sitneprotafib：从作用机制到科研试剂选型要点
已经有0人回复
-
PRMT5·MTA 抑制剂 MRTX1719 的科研应用
已经有0人回复
-
SW033291 科研使用解析：分子特征、储存与实验获取要点
已经有0人回复
-
泛 RAS 抑制新思路：大环肽拟似物如何同时牵住突变型与野生型 RAS？
已经有0人回复
-
TYK2/JAK1 双靶点工具化合物 Brepocitinib：激酶选择性、研究进展与实验应用全解析
已经有0人回复
-
矢车菊素-3-O-葡萄糖苷质控实录：从一张HPLC图谱读懂纯度与稳定性
已经有0人回复
gaoxiang6803
铜虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 286.2
- 散金: 45
- 红花: 1
- 帖子: 66
- 在线: 71.7小时
- 虫号: 3507686
- 注册: 2014-10-30
- 专业: 微生物生理与生物化学
2楼2015-08-11 12:31:31
3楼2015-08-11 14:07:41
gaoxiang6803
铜虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 286.2
- 散金: 45
- 红花: 1
- 帖子: 66
- 在线: 71.7小时
- 虫号: 3507686
- 注册: 2014-10-30
- 专业: 微生物生理与生物化学
4楼2015-08-12 07:41:03
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
hello everyone, i have finished differential expression analysis of my RNA-seq data and retrieve the transcripts of transcription factors(TF) from differentially expressed unigenes and non differentially expressed unigenes. then i have categorized those TFs to different TF families. then i realized there are many TFs sequences which blong to the same TF family overly expressed than some other TF families, some parts of my data: TF_families Differential Unchanged AP-2 0 2 ARID 2 5 bHLH 8 67 CG-1 1 1 COE 0 2 CP2 0 4 CSD 0 4 CSL 0 1 CUT 1 6 DDT 0 1 DM 0 6 E2F 0 3 ETS 2 10 Fork_head 2 22 . . . and i wanna find most expressed TF families in my DE TF sets. i saw a several papers analysed this kind of data and they used fisher's exact test for that. i searched some materials about fisher's exact test, but in those example fisher's test used for 2x2 contingency table, no more. here i still have no idea how to use fisher's test to my data. so could anyone explain to me how could i do solve this and is there any tool i can use for the analysis ? any suggestion would be highly appreciated. |
5楼2015-09-06 19:08:44