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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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半檐雨

银虫 (初入文坛)

[求助] 具有多个domain的蛋白家族构建进化树时要把除domain之外的序列全部删掉吗 已有1人参与

如题,如果是除domain之外全部删除,那删除之后是直接把各个domain拼接起来吗,各个domain的顺序要跟其在蛋白上的顺序一致吗
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jinxuan0904

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-08-14 23:28:39
半檐雨: 金币+20, 有帮助 2015-08-20 09:49:58
不用,用bioedit进行同源比对,切去多余的就行,再利用MegA 建立系统树!
2楼2015-08-11 13:44:34
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

3楼2015-08-11 18:34:14
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半檐雨

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jinxuan0904 at 2015-08-11 13:44:34
不用,用bioedit进行同源比对,切去多余的就行,再利用MegA 建立系统树!

谢谢,请问用bioedit进行同源比对用的是clustalw方法吗,切去多余的,这里“多余”的具体是指比对之后的哪段序列呢?
4楼2015-08-13 09:14:24
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jinxuan0904

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 半檐雨 at 2015-08-13 09:14:24
谢谢,请问用bioedit进行同源比对用的是clustalw方法吗,切去多余的,这里“多余”的具体是指比对之后的哪段序列呢?...

bioedit切同源比对后,多余的!
5楼2015-08-14 20:21:32
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qjzhihua

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by jinxuan0904 at 2015-08-14 20:21:32
bioedit切同源比对后,多余的!...

切去多余的,意思是只要中间大家都有的那一段吗?怎么切啊?一个一个的删吗?有没有快捷的方法啊?
6楼2015-09-08 10:25:37
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