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fogmoon

金虫 (小有名气)


[交流] 找过渡态,找出的过渡态能量在反应物和产物之间是什么鬼?

小弟已经出现多次这种情形了,通过qst2找出的过渡态能量应该要比初始状态和最终状态都高才对,但是我算出来的过渡态能量居然在两者之间
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xiaochong8693

木虫之王 (文坛精英)



fogmoon(金币+1): 谢谢参与
为楼主留下满满的、真诚的祝福
祝福楼主和各位虫友清凉一夏,事事如意,梦想成真!
6楼2015-08-10 18:53:30
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珠帘华梦

木虫 (著名写手)



fogmoon(金币+1): 谢谢参与
6666
8楼2015-08-10 19:00:34
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birdljc

铜虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
那你的虚频振动什么的都对么?
10楼2015-08-11 21:22:56
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flour_wheat

至尊木虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
怀疑你找到的不是过渡态,而是一种中间态,没有虚频。
可以尝试用QST3,根据你自己对反应的理解认为指定一种过渡态。也许会快些。
11楼2015-08-13 17:25:15
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fogmoon

金虫 (小有名气)


引用回帖:
11楼: Originally posted by flour_wheat at 2015-08-13 17:25:15
怀疑你找到的不是过渡态,而是一种中间态,没有虚频。
可以尝试用QST3,根据你自己对反应的理解认为指定一种过渡态。也许会快些。

我优化出的结构确实是一个虚频怎么办
12楼2015-08-15 10:20:10
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fogmoon

金虫 (小有名气)


引用回帖:
10楼: Originally posted by birdljc at 2015-08-11 21:22:56
那你的虚频振动什么的都对么?

虚频数是1,其它东西还不太会看,恳请赐教
13楼2015-08-15 10:22:23
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chenxin1992

银虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
很正常,QST2的初猜不一定是在local minima上,你找到的过渡态虚频指向对就行。
14楼2015-08-15 13:56:01
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fogmoon

金虫 (小有名气)


引用回帖:
14楼: Originally posted by chenxin1992 at 2015-08-15 13:56:01
很正常,QST2的初猜不一定是在local minima上,你找到的过渡态虚频指向对就行。

可是过渡态能量不是应该比初始状态和终止状态都高才是合理的呢?过渡态能量在两者之间很多事情就解释不了了额
15楼2015-08-16 10:23:28
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birdljc

铜虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
13楼: Originally posted by fogmoon at 2015-08-15 10:22:23
虚频数是1,其它东西还不太会看,恳请赐教...

就是看下算出的过渡态是不是只有一个虚频,看下过渡态分子的振动是不是你觉得合理的~也可以跑个irc看下~要不你就再用ts的方法试下

[ 发自小木虫客户端 ]
16楼2015-08-16 14:05:42
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chenxin1992

银虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
15楼: Originally posted by fogmoon at 2015-08-16 10:23:28
可是过渡态能量不是应该比初始状态和终止状态都高才是合理的呢?过渡态能量在两者之间很多事情就解释不了了额...

你QS2选的结构不是正好的反应物,产物。
17楼2015-08-28 22:30:30
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shaserena

新虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主,你的情况解决了吗?我也遇到一样的情况
18楼2015-08-31 10:33:57
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匿名

用户注销 (著名写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖仅楼主可见
19楼2015-08-31 12:37:08
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花开淡墨痕lw

新虫 (著名写手)


20楼2015-08-31 20:53:08
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花开淡墨痕lw

新虫 (著名写手)


引用回帖:
20楼: Originally posted by 花开淡墨痕lw at 2015-08-31 20:53:08
错了

同求解

发自小木虫Android客户端
21楼2015-08-31 20:54:23
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禁卫军

铜虫 (小有名气)



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找到的是中间体吧

发自小木虫Android客户端
22楼2015-09-21 23:16:59
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yolanda1234

金虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
所以极有可能不是过渡态。你可以查看虚频,然后normal mode。虚频数值太小也可能反映问题。总之再调整吧。

发自小木虫Android客户端
23楼2015-09-22 08:53:31
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dmbb2楼
2015-08-10 18:29   回复  
fogmoon(金币+1): 谢谢参与
假大空3楼
2015-08-10 18:36   回复  
fogmoon(金币+1): 谢谢参与
tzynew4楼
2015-08-10 18:41   回复  
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syhorchid5楼
2015-08-10 18:42   回复  
fogmoon(金币+1): 谢谢参与
2015-08-10 18:55   回复  
fogmoon(金币+1): 谢谢参与
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kinple9楼
2015-08-10 19:01   回复  
fogmoon(金币+1): 谢谢参与
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