24小时热门版块排行榜    

查看: 2924  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

熊猫高高

新虫 (初入文坛)

[交流] 关于转录组测序后Unigene序列的问题

前段时间测了昆虫不同处理的转录组,我做的这个虫子基本没有基因测序出来,所以除了差异基因外,在得到的unigene注释的结果中也有很多感兴趣的其他基因,我根据unigene序列设计的普通PCR的引物,但是测序之后在NCBI上却搜索不到,请问各位虫友,是不是一定要经过RNA干扰验证才可以证明这个基因注释的正确性?在NCBI上检测不到其他近缘物种的相似序列是不是有其他原因?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone856

银虫 (小有名气)

商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容

小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我觉得你应该对序列做一个全面的分析,看看这个基因是否是一个全新的基因。如果不是,就要在实验操作中找问题了。
6楼2015-08-11 09:48:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
测序后比对时用blastx程序。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2015-08-10 11:42:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

熊猫高高

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2015-08-10 11:42:24
测序后比对时用blastx程序。

blastX也搜索不到,是什么原因呢?也就是说这个方法应该没错是吧

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2015-08-10 20:51:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

熊猫高高

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2015-08-10 11:42:24
测序后比对时用blastx程序。

我再重新设计引物试试吧

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2015-08-10 20:52:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 40ms4Wlo4umh 2026-09-14 3/150 2026-09-16 21:26 by MHf40yA0Uhyb
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 5/250 2026-09-16 20:38 by MHf40yA0Uhyb
[博后之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 7/350 2026-09-16 19:27 by rRvxEj3zorCy
[考研] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-16 17:15 by i3KBRD19ERkG
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-16 17:12 by i3KBRD19ERkG
[考博] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-16 17:00 by i3KBRD19ERkG
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 4/200 2026-09-16 16:51 by i3KBRD19ERkG
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 5/250 2026-09-16 16:27 by i3KBRD19ERkG
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 vZfe6xYu34yj 2026-09-14 3/150 2026-09-16 08:51 by SjQobnC04j06
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 4/200 2026-09-16 04:27 by DgNGHc3h5tPl
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 7/350 2026-09-16 03:26 by DgNGHc3h5tPl
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 Aj1rhIDL5ixY 2026-09-14 3/150 2026-09-15 20:26 by zNcEhTcH7ihq
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 Aj1rhIDL5ixY 2026-09-14 3/150 2026-09-15 19:59 by CgyNCDVNhGVg
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 5/250 2026-09-15 16:59 by CgyNCDVNhGVg
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-15 14:34 by VMDqgnlKimtZ
[教师之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 08:26 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 08:14 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 3/150 2026-09-15 07:46 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-15 05:38 by 5BDX0d0WFp7t
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 6/300 2026-09-14 22:37 by vZfe6xYu34yj
信息提示
请填处理意见