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xuguang09280036

新虫 (初入文坛)

[交流] 有关载体去磷酸化的

最近做 载体的 去磷酸化 效果不是很好     不知各位高手 都是如何做的? 我是 直接在50 度,CIAP反应了 一个小时 行吗 ?  好像 还有37 度 的 一个反应 ,不过没做 , 不知道 37 度 和 50 度 的 反应的 原理是什么啊 ?? 谢谢 !!!
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xuguang09280036

新虫 (初入文坛)

可说明书上说的是 50 度反应半个小时    啊 ?!    那三十七度反应多长时间呢 ? 谢谢
4楼2008-08-17 13:24:54
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chysx6

铁杆木虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
reasonspare(金币+4,VIP+0):谢谢分享,欢迎常来
小牛肠碱性磷酸酶(CIP)
(Alkaline Phosphatase, Calf Intestinal (CIP) )
用途:
除去核酸3′或5′末端的磷酸基团
为5′末端标记准备模板
防止DNA片段的自连接
蛋白质的去磷酸化

反应条件:37°C温育


不知楼主为什么一直提到50度,来源于小牛肠粘膜的酶最适反应温度应该接近37度才对
50度的原理就是酶的催化效率很低而且很快失活,效果不好在意料之中
37度的原理就是最适反应温度催化效率高,活性持续时间长,所以会达到很好的效果
2楼2008-08-16 11:09:47
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香菱儿

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):thx
Alkaline Phosphatase, Calf Intestinal  的 kit 上是怎么说的?我记得是50度的
我当时做也摸索了好久
漫洒英雄泪,相离处士家。谢慈悲剃度在莲台下。没缘法转眼分离乍。赤条条来去无牵挂。那里讨烟蓑雨笠卷单行?一任俺芒鞋破钵随缘化!
3楼2008-08-16 13:34:51
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chysx6

铁杆木虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
reasonspare(金币+5,VIP+0):谢谢分享,欢迎常来
小牛肠碱性磷酸酶(CIP)
(Alkaline Phosphatase, Calf Intestinal (CIP) )   
#M0290V 500 Units 319.00 元
#M0290S 1,000 Units 629.00 元
#M0290L 5,000 Units 2,789.00 元

产品说明:碱性磷酸酶能催化除去DNA、RNA、三磷酸核糖核苷和三磷酸脱氧核糖核苷的5′磷酸基团。由于CIP处理后的DNA片段缺少连接酶所要求的5′磷酸末端,因此它们不能进行自连接(1)。这个特性可以在克隆时降低载体DNA的背景。

来源:小牛肠粘膜。

反应缓冲液: 1X NEBuffer 3
100 mM NaCl, 50 mM Tris-HCl, 10 mM MgCl2 , 1 mM DTT (pH 7.9 @ 25°C)。
另外,CIP在NEBuffers 2、NEBuffers 4 以及EcoR I和BamH I的Reaction Buffer中也有活性。

CIP去磷酸化步骤:

将DNA溶在1X NEBuffer (0.5 µg/10 µl)中。
每 µg载体DNA加0.5单位的酶。
37°C温育60 分钟。
通过胶回收、柱离心或酚抽提方法纯化DNA。
质量保证: CIP 由New England Biolabs的芬兰分公司 Finnzymes Oy 所纯化,不含核酸外切酶、核酸内切酶或RNA酶,质量控制检测在Finnzymes Oy公司进行,并经New England Biolabs认证。

单位定义:在1 ml反应体系中,37°C、1分钟催化1 µmol的对-硝基酚磷酸(pNPP)水解成对硝基酚(pNP)所需的酶量定义为一个活力单位(2)。

活性检测条件: 1 M 乙二胺(pH 9.8),0.5 mM MgCl2,10 mM 对-硝基酚磷酸和适量的酶(这些条件仅用于定量检测酶活力)。

浓度: 10,000 units/ml。

贮存条件: 50 mM KCl, 10 mM Tris-HCl (pH 8.2), 1 mM MgCl2, 0.1 mM ZnCl2 和50%甘油,-20°C 贮存。

热失活条件: 无

参考文献:
1. Sambrook, J., Fritsch, E. F. and Maniatis, T. (1989). Molecular Cloning: A Laboratory Manual, (2nd ed.), (p. 5.72). Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press.
2. Mossner, E., Boll, M. and Pfleiderer, G. (1980) Hoppe-Seyler's Z. Physiol. Chem. 361, 543-549.
5楼2008-08-17 13:59:34
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