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水草

[交流] BstX1酶切问题

BstX1酶切问题

有用过BstX1的吗?

我的质粒要BstX1和Hindlll双酶切,由于Hindlll Buffer M,37度,BstX1 Buffer H,45度。我先Hindlll 切,跑电泳看都切开了,其余的液体纯化回收,BstX1 切,结果切不动,过夜也不行。能给点建议吗?谢谢!

[ Last edited by 水草 on 2008-8-14 at 19:55 ]
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jasco

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
reasonspare(金币+4,VIP+0):thx
水草(金币+5,VIP+0):感谢帮助!我的两个酶切位点较近,我再查查!十分感谢!
我的建议是先用难切开的酶单切,再用容易的酶单切。对于你的两个酶,明显BstX I 相对来说难切一些,所以建议先BstX I来切,在确保单切完全后回收,再用Hind III来酶切。

如果你的dna多的话,可以同时先分别用BstX I和Hind III单切,切开回收后在分别用Hind III和BstX I切,分别回收酶切产物。这样能节约时间。

另外,看你写的buffer,估计你用的takara的酶,我觉得他家常用酶还行,象BstX I这种,我还是信任NEB的,我看了看, NEB这个酶反应温度是55度呢。

还有一个问题,你这两个酶切位点间隔多少碱基?如果间隔少可能会影像你的酶切。
6楼2008-08-15 11:15:58
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
水草(金币+2,VIP+0):谢谢!
如果是先BstX1呢?有没有试过
如果这样还切不动那么怀疑是酶的问题
当然不排除DNA提得不干净(但也不至于完全切不动)
2楼2008-08-14 19:38:49
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chysx6

铁杆木虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
水草(金币+4,VIP+0):谢谢!
用BstX1酶单切,
如果切不开,就考虑酶本身的问题,解决方法,再买一支酶
如果切开了,那就是楼主先用HindIII切完后对DNA造成的影响,解决方法,先用BstX1酶单切,回收后再用HindIII切
3楼2008-08-14 20:26:14
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chysx6

铁杆木虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
水草(金币+10,VIP+0):谢谢!我去试试。
补充一点
从BstX1本身的识别序列分析,
5' ... C C A N N N N N^N T G G ... 3'
3' ... G G T N^N N N N N A C C ... 5'
可见其为大亚基的限切酶
这种酶从动力学过程上来说,对环型DNA的切割很容易比对线型DNA切割效果好,
分子过程是结合于DNA上某些序列,向下扫描至酶切位点
而本身的环型结构也利于酶的切割
所以在酶确定好使的情况下,强烈建议楼主先进行BstX1的酶切
4楼2008-08-14 20:43:11
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