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克隆全长引物设计时问题
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设计梨中的引物,具体梨材料属于白梨系统 之前自己也设计过引物,但是现在设计引物注意的问题有点模糊,网上介绍的注意事项基本在实际问题中不管用 C3H ,CHS和CHI在NCBI中已经有很多mRNA序列的报道,但是在设计引物时遇到一些问题 例如"Pyrus x bretschneideri isolate Yanbian chalcone synthase (CHS) mRNA, complete cds"蛋白翻译第一个M在序列的第一个碱基,第一个"-"在最后一个碱基. 这种情况设计上游引物从第一个碱基,下游引物从第二个碱基 吗? CHI这个基因在梨中很多,但是都是短片段,也出现上述类似情况,BLAST,核酸比蛋白比对不通 C3H在梨中没有报道,近缘物种也几乎没有.这种情况怎么办呢? 已经研究很多天了,但是还是很头疼~~~~ 有没有哪个高人肯登陆NCBI帮我看看,帮我设计个引物,或者告诉这种引物设计注意的问题? 跪谢~~~~ |
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