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lifei_dut金虫 (小有名气)
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【求助】autodock 4.o中如何添加氧原子的参数？
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| 计算中出现问题。如下图所示。还望 高手不吝赐教。 |
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chemozhang
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2楼2008-08-14 20:56:58
lifei_dut
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- 专业: 化学环境污染与健康
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感谢回复，这是我的.gpf文件， 能具体指导一下如何添加？十分感谢 npts 40 50 60 # num.grid points in xyz gridfld ER.maps.fld # grid_data_file spacing 0.602777777778 # spacing(A) receptor_types A C HD N OA SA # receptor atom types ligand_types A C OA HD N # ligand atom types receptor ER.pdbqt # macromolecule gridcenter 20.323 28.452 12.094 # xyz-coordinates or auto smooth 0.5 # store minimum energy w/in rad(A) map ER.A.map # atom-specific affinity map map ER.C.map # atom-specific affinity map map ER.OA.map # atom-specific affinity map map ER.HD.map # atom-specific affinity map map ER.N.map # atom-specific affinity map elecmap ER.e.map # electrostatic potential map dsolvmap ER.d.map # desolvation potential map dielectric -0.1465 # <0, AD4 distance-dep.diel;>0, constant |
3楼2008-08-16 09:05:33
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