24小时热门版块排行榜    

查看: 505  |  回复: 6
当前主题已经存档。

feehy

金虫 (小有名气)

[交流] 关于测序的问题

小弟弱弱的问下,什么是双向测序,引物如何设计?多谢各位了。
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hqhe

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
reasonspare(金币+3,VIP+0):thx
DNA是两条互补序列,单向测序就是从一个方向测,也就是直接得到一条链的序列;双向测就和PCR一样是分别根据两条链的5'端扩增而测序,得到两条链的序列。
一般来说,在没有特殊要求的情况下,上海生工这样的测序公司的测序结果在800个核苷酸内是非常可靠的,1000个核苷酸内相对可靠,1200以后都只能做参考了。
因此,如果你的基因序列在1500个左右,你从一个方向测定的结果就不能准确判断后面500-700核苷酸序列的正确与否,就需要另一个方向也测,然后把两个结果分别取其可靠的部分综合判断
至于测序的引物,如果你是连接在常用的载体上的,只需要告诉公司你连接的载体是什么,公司有相应的通用引物的,如果你连接到其它一些公司没有相应测序引物的载体上,就需要提供引物序列,最好是你扩增基因的PCR引物序列,这样能保证把你的序列都包含在内
说了这么多,不知道说清楚没有,希望能对你有所帮助
2楼2008-08-13 09:42:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

feehy

金虫 (小有名气)

好的,多谢。我们都是自己测序,在800bp左右。拿到单向测序的序列后如何进行blast呢?
3楼2008-08-13 09:51:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jasco

木虫 (正式写手)

★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):thx
引用回帖:
Originally posted by feehy at 2008-8-13 09:51:
好的,多谢。我们都是自己测序,在800bp左右。拿到单向测序的序列后如何进行blast呢?

http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... mp;SHOW_DEFAULTS=on

测序结果贴进去
4楼2008-08-13 13:08:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxlxyc

铜虫 (小有名气)


xyklmu(金币+1,VIP+0):感谢答复
在NCBI进行BLAST即可
5楼2008-08-14 10:47:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangxu84


xyklmu(金币+1,VIP+0):感谢答复
双向的话要把两条结果拼接一下再比对
6楼2008-08-14 13:24:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

feehy

金虫 (小有名气)

好的,多谢各位的帮助!
7楼2008-08-25 14:42:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 feehy 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +7 chengyan1220 2026-08-21 8/400 2026-08-21 15:19 by chengyan1220
[基金申请] 让我中一个面上吧! +11 大萍1987 2026-08-20 13/650 2026-08-21 14:48 by 20120902066
[基金申请] 人气不行了 +7 fansofjerry 2026-08-21 7/350 2026-08-21 14:13 by Vivilian
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +15 医学老男孩 2026-08-20 18/900 2026-08-21 13:46 by 医学老男孩
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 什么时候开奖? +7 CrisMessi 2026-08-18 7/350 2026-08-21 12:15 by weiyin
[基金申请] 时间戳又变了 +12 wuchongjun 2026-08-20 18/900 2026-08-21 11:53 by wuchongjun
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +15 kkkl_v 2026-08-19 16/800 2026-08-21 11:22 by 365372687
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 13/650 2026-08-21 08:30 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见