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求如何使用Mercury！
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使用Mercury计算二面角时，如何定义两个平面？我选择了几个原子，然后选择测量角度，但是不出现角度值。 谢谢！ |
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以前发过的，先再转贴过来 Mercury软件中关于平面的二个计算 一. 定义平面 1. 打开Mercury软件。 2. 调用CIF文件（res、pdb文件都可以）。 3. 选择Calculate功能栏里的planes。 4. 点击 "New Plane"。 5. 在最下方的Colour里选择一种颜色（选好后点击OK）。 6. 在Hg图里逐个点击组成平面的原子。 7. 全部选好后点击OK，在Hg图面上一个平面就产生了。 8. 重复上面第4、5、6、7步，产生新的平面（但要注意换颜色）。 9. 全部平面都制定好后点击"Close",则可以开始计算了。 二.计算平面关系 1. 在Mercury软件的右上方"Picking Mode"栏中选择。 2. 计算平面间距选"Measure Distance" 3. 计算平面交角（二面角）选择"Measure Angle" 4. 注意 a) 计算出的角度都是锐角，可根据自己的需要适时换算成钝角。 b) Mercury软件计算得到的距离和角度都不带偏差， 可根据CIF中的平均偏差估计一个适当的偏差值。 |
2楼2008-08-10 10:20:31
3楼2008-08-11 10:07:19