应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 请问VASP计算时，为什么我的POSCAR稍微改了下，结果能差那么多
282/3返回列表上一页123下一页
查看: 1188  |  回复: 27
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

suspend2014

新虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by wmy8802217 at 2015-07-23 08:47:11
嗯，第二行如果不是1.0000，下面的原子坐标必须所有的都除以这个数字，Cartesian也一样。...

好像说是Cartesian表示的话第二行只能是1
赞一下 回复此楼
11楼2015-07-23 10:43:07
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

suspend2014

新虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by jpchou at 2015-07-23 03:44:10
比如我想算LA2O3，最终得到的TOTEN，是不是要减去2*LA的参考组态的能量与3*O的参考组态的能量才是我要求的LA2O3的能量呢？

> 我想.....
   你這裡指的 "LA2O3的能量" 是想要問 "LA2O3 的 for ...

不是，就想问的是LA2O3本身的能量，应该用MS算的有好千，VASP却只有40多，我想是不是要减去POTCAR里的EATOM
赞一下 回复此楼
12楼2015-07-23 10:52:01
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wmy8802217

木虫 (正式写手)
引用回帖:
11楼: Originally posted by suspend2014 at 2015-07-23 10:43:07
好像说是Cartesian表示的话第二行只能是1...

可以去看看VASP手册，里边都没这个说法。
看手册40页：

Cubic BN
3.57
0.0 0.5 0.5
0.5 0.0 0.5
0.5 0.5 0.0
1 1
Selective dynamics
Cartesian
0.00 0.00 0.00 T T F
0.25 0.25 0.25 F F F

很明显，这里第二行不是1，而且下面的原子位置都是小于1的，明显就是除以3.57的结果。
赞一下 回复此楼
凝聚态理论与计算物理
13楼2015-07-23 10:54:46
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wmy8802217

木虫 (正式写手)
引用回帖:
11楼: Originally posted by suspend2014 at 2015-07-23 10:43:07
好像说是Cartesian表示的话第二行只能是1...

可以去看看VASP手册，里边都没这个说法。
看手册40页：

Cubic BN
3.57
0.0 0.5 0.5
0.5 0.0 0.5
0.5 0.5 0.0
1 1
Selective dynamics
Cartesian
0.00 0.00 0.00 T T F
0.25 0.25 0.25 F F F

很明显，这里第二行不是1，而且下面的原子位置都是小于1的，明显就是除以3.57的结果。
赞一下 回复此楼
凝聚态理论与计算物理
14楼2015-07-23 10:55:30
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

suspend2014

新虫 (小有名气)
引用回帖:
14楼: Originally posted by wmy8802217 at 2015-07-23 10:55:30
可以去看看VASP手册，里边都没这个说法。
看手册40页：

Cubic BN
3.57
0.0 0.5 0.5
0.5 0.0 0.5
0.5 0.5 0.0
1 1
Selective dynamics
Cartesian
0.00 0.00 0.00 T T F
0.25 0.25 0.25 F F F

很明显 ...

可是我的POSCAR已经全部除过了啊，换成Direct就没错
赞一下 回复此楼
15楼2015-07-23 13:03:10
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wmy8802217

木虫 (正式写手)
引用回帖:
15楼: Originally posted by suspend2014 at 2015-07-23 13:03:10
可是我的POSCAR已经全部除过了啊，换成Direct就没错...

Direct的原子坐标是用上面的晶格矢量为基矢的,
Cartesian的坐标是xyz为基矢的,当然不能直接换.
赞一下 回复此楼
凝聚态理论与计算物理
16楼2015-07-23 13:16:51
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jpchou

专家顾问 (著名写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by wmy8802217 at 2015-07-23 10:55:30
可以去看看VASP手册，里边都没这个说法。
看手册40页：

Cubic BN
3.57
0.0 0.5 0.5
0.5 0.0 0.5
0.5 0.5 0.0
1 1
Selective dynamics
Cartesian
0.00 0.00 0.00 T T F
0.25 0.25 0.25 F F F

很明显 ...

手冊 40 頁是有問題的
它寫出了 POSCAR 的兩種寫法 (Cartesian & Direct)

第一種，就是你講的這種
Cubic BN
3.57
0.0 0.5 0.5
0.5 0.0 0.5
0.5 0.5 0.0
1 1
Selective dynamics
Cartesian
0.00 0.00 0.00 T T F
0.25 0.25 0.25 F F F
Cartesian
0.01 0.01 0.01
0.00 0.00 0.00
optionally predictor-corrector coordinates
given on file CONTCAR of MD-run
....
....


第二種，Direct

Cubic BN
3.57
0.0 0.5 0.5
0.5 0.0 0.5
0.5 0.5 0.0
1 1
Direct
0.00 0.00 0.00
0.25 0.25 0.25


注意到了嬤
兩種 POSCAR 內的兩顆原子
都是在 0, 0, 0  &   1/4, 1/4, 1/4 的位置上
明顯的表示~ VASP 手冊在這一段有東西寫錯 (TYPO)
赞一下 回复此楼
17楼2015-07-23 14:47:44
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jpchou

专家顾问 (著名写手)
第二個 POSCAR 下面的原子座標是 "不用" 除以 3.9
比較好的修改方式是把這個 3.9 乘進 lattice vector 內
讓第二行 lattice constant 為 1.0000
我有簡單測了一下
這樣做是沒問題的
赞一下 回复此楼
18楼2015-07-23 14:51:24
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jpchou

专家顾问 (著名写手)
引用回帖:
12楼: Originally posted by suspend2014 at 2015-07-23 10:52:01
不是，就想问的是LA2O3本身的能量，应该用MS算的有好千，VASP却只有40多，我想是不是要减去POTCAR里的EATOM...

如果你是要把VASP結果拿去與MS對比
那建議還是用 formation energy 比較合適
赞一下 回复此楼
19楼2015-07-23 16:13:25
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wmy8802217

木虫 (正式写手)
引用回帖:
18楼: Originally posted by jpchou at 2015-07-23 14:51:24
第二個 POSCAR 下面的原子座標是 "不用" 除以 3.9
比較好的修改方式是把這個 3.9 乘進 lattice vector 內
讓第二行 lattice constant 為 1.0000
我有簡單測了一下
這樣做是沒問題的

你可以算算，拿手算，这种体系刚好两种坐标是等价的。或者你用VESTA之类的看看，体系完全一样。
0.25*【（0 0.5 0.5）+（0.5 0 0.5）+（0.5 0.5 0）】=（0.25 0.25 0.25）
赞一下 回复此楼
凝聚态理论与计算物理
20楼2015-07-23 16:29:25
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 suspend2014 的主题更新
282/3返回列表上一页123下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭