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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 从代谢通路定位到基因表达
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yanjiacheng

木虫 (正式写手)

[求助] 从代谢通路定位到基因表达 已有2人参与

如题，如何从观测到的代谢通路的变化定位到相应的参与基因呢？
不甚感激啊。。。
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持黄金为珍贵，知安乐方值千金。
1楼 2015-07-22 14:49:45
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-07-22 17:38:48
yanjiacheng: 金币+5, ★★★很有帮助, 多谢呢 2015-07-23 12:02:14
看通路中有哪些基因，然后根据基因序列设计定量引物，做荧光定量，看基因表达量变化是否与代谢通路变化一致。
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2楼2015-07-22 17:33:11
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yanjiacheng

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2015-07-22 17:33:11
看通路中有哪些基因，然后根据基因序列设计定量引物，做荧光定量，看基因表达量变化是否与代谢通路变化一致。

多谢回复
就是不知道该怎么查找通路中的基因，亲可否告知下。。我是新手一枚
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持黄金为珍贵，知安乐方值千金。
3楼2015-07-23 10:52:29
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maomaoliu84

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by yanjiacheng at 2015-07-23 10:52:29
多谢回复
就是不知道该怎么查找通路中的基因，亲可否告知下。。我是新手一枚...

KEGG里查到相关通路，基因都有标注
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4楼2015-07-23 11:06:22
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maomaoliu84

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
yanjiacheng: 金币+5, ★★★很有帮助, 多谢啦 2015-07-23 12:02:29
KEGG里可以定位通路相关的基因，尤其是你的目标基因组已测序或类似基因组完成测序的情况下
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5楼2015-07-23 11:07:29
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by yanjiacheng at 2015-07-23 10:52:29
多谢回复
就是不知道该怎么查找通路中的基因，亲可否告知下。。我是新手一枚...

KEGG库中可以查到代谢通路中涉及到的基因及底物。
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6楼2015-07-23 16:42:06
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我是鱼豆腐

金虫 (小有名气)
高通量测序下就可以了
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7楼2015-07-24 09:31:13
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yanjiacheng

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 我是鱼豆腐 at 2015-07-24 09:31:13
高通量测序下就可以了

谢谢哇
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持黄金为珍贵，知安乐方值千金。
8楼2015-07-24 17:40:32
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