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汕头大学海洋科学接受调剂
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香草柠檬M

铁虫 (初入文坛)

[求助] 植物ITS序列的通用引物有哪些？有什么区别？ 已有1人参与

陈士林《植物DNA条形码》一书中收录了两种ITS序列的通用引物，分别是5a few  4re和 5F 4R，又从文献中看到ITS1和4，想问一下这几个引物的区别
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1楼 2015-07-20 09:03:46
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香草柠檬M

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2015-07-20 11:44:40
扩增的产物大小不同，覆盖的ITS、rDNA区域不同。用引物对直接做blastn就可以判断出每对引物具体扩增的是哪一段。

你的意思是扩增产物都包括ITS这段序列，只是长度不一样？那序列比对时都要切掉引物，设计不同的引物有什么意义呢
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3楼2015-07-20 14:33:53
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰，手有余香，分子生物期待您更多精彩。 2015-07-20 13:21:12
扩增的产物大小不同，覆盖的ITS、rDNA区域不同。用引物对直接做blastn就可以判断出每对引物具体扩增的是哪一段。
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2楼2015-07-20 11:44:40
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