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关于启动子区域分析,查找顺式元件
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我用plantcare 和place 对我关心的基因上游1500bp做了检测也得到了相应结果,可是最近看文献里(2010和2012年的文献)里面提到两个新的顺式元件,正好是我所关心的,可是在Plantcare和Place的检测中都没发现,我自己手动在我的目的基因上游区域进行查找,查找到了相关元件,现在想问一下各位虫友: 1.pantcare 和place 查找不到是不是因为数据库没有更新收录这两个顺式元件 2.由于这个顺式元件给出的序列是consensus sequence因而某个位点是可变的,我在手动查找时候是排列组合了一下,这样是正确 3.大家有没有什么好的方法推荐 多谢大家了,在线等,谢谢 |
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