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关于启动子区域分析,查找顺式元件
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策马入林
新虫
(小有名气)
应助: 2
(幼儿园)
金币: 121.8
帖子: 188
在线: 135.8小时
虫号: 2042612
[交流]
关于启动子区域分析,查找顺式元件
我用plantcare 和place 对我关心的基因上游1500bp做了检测也得到了相应结果,可是最近看文献里(2010和2012年的文献)里面提到两个新的顺式元件,正好是我所关心的,可是在Plantcare和Place的检测中都没发现,我自己手动在我的目的基因上游区域进行查找,查找到了相关元件,现在想问一下各位虫友:
1.pantcare 和place 查找不到是不是因为数据库没有更新收录这两个顺式元件
2.由于这个顺式元件给出的序列是consensus sequence因而某个位点是可变的,我在手动查找时候是排列组合了一下,这样是正确
3.大家有没有什么好的方法推荐
多谢大家了,在线等,谢谢
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1楼
2015-07-17 10:52:10
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一桶稀泥
木虫
(正式写手)
应助: 0
(幼儿园)
金币: 1941.5
帖子: 366
在线: 90.8小时
虫号: 2389865
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你好 我刚接触这块,遇到和你相同的问题 想知道问题解决了吗?谢谢
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(1人)
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9楼
2016-08-13 23:30:31
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dmbb
2楼
2015-07-17 10:57
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cxjzly2008
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2015-07-17 10:59
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neu234
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Biotage
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