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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 关于启动子区域分析，查找顺式元件
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策马入林

新虫 (小有名气)

[交流] 关于启动子区域分析，查找顺式元件

我用plantcare 和place 对我关心的基因上游1500bp做了检测也得到了相应结果，可是最近看文献里（2010和2012年的文献）里面提到两个新的顺式元件，正好是我所关心的，可是在Plantcare和Place的检测中都没发现，我自己手动在我的目的基因上游区域进行查找，查找到了相关元件，现在想问一下各位虫友：
1.pantcare 和place 查找不到是不是因为数据库没有更新收录这两个顺式元件
2.由于这个顺式元件给出的序列是consensus sequence因而某个位点是可变的，我在手动查找时候是排列组合了一下，这样是正确
3.大家有没有什么好的方法推荐
多谢大家了，在线等，谢谢
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1楼 2015-07-17 10:52:10
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一桶稀泥

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你好 我刚接触这块，遇到和你相同的问题 想知道问题解决了吗？谢谢
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9楼2016-08-13 23:30:31
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dmbb2楼
2015-07-17 10:57   回复  
策马入林(金币+1): 谢谢参与
cxjzly20083楼
2015-07-17 10:59   回复  
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neu2344楼
2015-07-17 11:01   回复  
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假大空5楼
2015-07-17 11:07   回复  
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Biotage6楼
2015-07-17 12:17   回复  
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chengnuo25277楼
2015-07-18 15:31   回复  
CLao8楼
2015-07-28 12:05   回复  
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