24小时热门版块排行榜    

查看: 1557  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

阿克飞顿

金虫 (正式写手)

[求助] VASP中CI-NEB求过渡态出错 已有1人参与

通过bsub –q q_x86_kanglh –n 72 vasp提交任务,再通过bjobs查看任务进行状态,如图1
现在仍然这样
但是,打开log.txt文件时,(文件路径kanglh/zhaofei/TS1)文件开头显示如图2
任务目前显示还在计算中,我在求过渡态时在00和09之间插入了8个构象,
这是什么原因呢,是我的INCAR设置有问题还是提交任务所需核心数超出实际分配的核心数?
附件有我的INCAR文件和生成的log.txt文件。VASP中CI-NEB求过渡态出错
1.png


VASP中CI-NEB求过渡态出错-1
2.png
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : log.txt
  • 2015-07-16 13:09:43, 11.52 K
  • 附件 2 : INCAR
  • 2015-07-16 13:10:36, 2.52 K

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Am Melody

银虫 (小有名气)

楼主,你好。
请问你有编译CI-NEB的原始文件吗,或者介绍这个程序的相关的网站,求分享
使沙漠显得美丽的,是它在什么地方藏着一口水井。
5楼2016-03-21 22:46:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

jpchou

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
阿克飞顿: 金币+3, 有帮助 2015-07-17 16:59:48
可能你用了 NPAR = 4 ?

試試用 64 個 cores 去計算應該就可以了

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2015-07-16 15:34:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

阿克飞顿

金虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by jpchou at 2015-07-16 15:34:05
可能你用了 NPAR = 4 ?

試試用 64 個 cores 去計算應該就可以了

谢谢,我把NPAR改成3就好了,可以正常计算了
3楼2015-07-17 16:59:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

阿克飞顿

金虫 (正式写手)

追问:NPAR改成3后,对资源里利用率有什么影响,会不会导致计算速度下降。比如我将NPAR改为9或者1都可以正常计算,但计算速度会有什么差别???
4楼2015-07-17 17:01:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] FileCode能看出啥? +8 要乐观耀哥 2026-08-10 25/1250 2026-08-13 10:58 by 要乐观耀哥
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +9 majunge000 2026-08-10 11/550 2026-08-13 10:40 by ZH远山
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +9 瞬息宇宙 2026-08-12 9/450 2026-08-13 10:12 by Vivilian
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +22 Lanmanbaby 2026-08-09 36/1800 2026-08-12 22:50 by sdfapple719
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +4 工厂打螺丝 2026-08-08 4/200 2026-08-12 09:18 by hansi2025
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 10/500 2026-08-12 09:12 by 布布和一二
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +8 Tide man 2026-08-10 9/450 2026-08-11 20:39 by beefly
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 听说今天filecode变了 +26 布布和一二 2026-08-06 49/2450 2026-08-11 13:18 by WH3796
[基金申请] 静等基金结果 +5 gjjjzhong 2026-08-10 16/800 2026-08-10 17:19 by Tide man
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
信息提示
请填处理意见