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阿克飞顿

金虫 (正式写手)

[求助] VASP中CI-NEB求过渡态出错 已有1人参与

通过bsub –q q_x86_kanglh –n 72 vasp提交任务,再通过bjobs查看任务进行状态,如图1
现在仍然这样
但是,打开log.txt文件时,(文件路径kanglh/zhaofei/TS1)文件开头显示如图2
任务目前显示还在计算中,我在求过渡态时在00和09之间插入了8个构象,
这是什么原因呢,是我的INCAR设置有问题还是提交任务所需核心数超出实际分配的核心数?
附件有我的INCAR文件和生成的log.txt文件。VASP中CI-NEB求过渡态出错
1.png


VASP中CI-NEB求过渡态出错-1
2.png
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  • 附件 1 : log.txt
  • 2015-07-16 13:09:43, 11.52 K
  • 附件 2 : INCAR
  • 2015-07-16 13:10:36, 2.52 K

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jpchou

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
阿克飞顿: 金币+3, 有帮助 2015-07-17 16:59:48
可能你用了 NPAR = 4 ?

試試用 64 個 cores 去計算應該就可以了

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2015-07-16 15:34:05
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阿克飞顿

金虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by jpchou at 2015-07-16 15:34:05
可能你用了 NPAR = 4 ?

試試用 64 個 cores 去計算應該就可以了

谢谢,我把NPAR改成3就好了,可以正常计算了
3楼2015-07-17 16:59:30
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阿克飞顿

金虫 (正式写手)

追问:NPAR改成3后,对资源里利用率有什么影响,会不会导致计算速度下降。比如我将NPAR改为9或者1都可以正常计算,但计算速度会有什么差别???
4楼2015-07-17 17:01:48
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Am Melody

银虫 (小有名气)

楼主,你好。
请问你有编译CI-NEB的原始文件吗,或者介绍这个程序的相关的网站,求分享
使沙漠显得美丽的,是它在什么地方藏着一口水井。
5楼2016-03-21 22:46:42
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luzihen

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by Am Melody at 2016-03-21 22:46:42
楼主,你好。
请问你有编译CI-NEB的原始文件吗,或者介绍这个程序的相关的网站,求分享

搜索vtst vasp neb
6楼2016-03-25 15:07:50
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