应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » VASP中CI-NEB求过渡态出错
61/1返回列表
查看: 1317  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

阿克飞顿

金虫 (正式写手)

[求助] VASP中CI-NEB求过渡态出错 已有1人参与

通过bsub –q q_x86_kanglh –n 72 vasp提交任务,再通过bjobs查看任务进行状态，如图1
现在仍然这样
但是，打开log.txt文件时，（文件路径kanglh/zhaofei/TS1）文件开头显示如图2
任务目前显示还在计算中，我在求过渡态时在00和09之间插入了8个构象，
这是什么原因呢，是我的INCAR设置有问题还是提交任务所需核心数超出实际分配的核心数？
附件有我的INCAR文件和生成的log.txt文件。VASP中CI-NEB求过渡态出错
1.png


VASP中CI-NEB求过渡态出错-1
2.png
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : log.txt
    • 2015-07-16 13:09:43, 11.52 K
  • 附件 2 : INCAR
    • 2015-07-16 13:10:36, 2.52 K

» 猜你喜欢
1楼 2015-07-16 13:09:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jpchou

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
阿克飞顿: 金币+3, ★有帮助 2015-07-17 16:59:48
可能你用了 NPAR = 4 ?

試試用 64 個 cores 去計算應該就可以了
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

阿克飞顿
2楼2015-07-16 15:34:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

阿克飞顿

金虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by jpchou at 2015-07-16 15:34:05
可能你用了 NPAR = 4 ?

試試用 64 個 cores 去計算應該就可以了

谢谢，我把NPAR改成3就好了，可以正常计算了
赞一下 回复此楼
3楼2015-07-17 16:59:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

阿克飞顿

金虫 (正式写手)
追问：NPAR改成3后，对资源里利用率有什么影响，会不会导致计算速度下降。比如我将NPAR改为9或者1都可以正常计算，但计算速度会有什么差别？？？
赞一下 回复此楼
4楼2015-07-17 17:01:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Am Melody

银虫 (小有名气)
楼主，你好。
请问你有编译CI-NEB的原始文件吗，或者介绍这个程序的相关的网站，求分享
赞一下 回复此楼
使沙漠显得美丽的，是它在什么地方藏着一口水井。
5楼2016-03-21 22:46:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luzihen

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by Am Melody at 2016-03-21 22:46:42
楼主，你好。
请问你有编译CI-NEB的原始文件吗，或者介绍这个程序的相关的网站，求分享

搜索vtst vasp neb
赞一下 回复此楼
6楼2016-03-25 15:07:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 阿克飞顿 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 考研求调剂 +3 橘颂. 2026-03-17 4/200 2026-03-17 21:43 by 有只狸奴
[考研] 085601材料工程专硕求调剂 +5 慕寒mio 2026-03-16 5/250 2026-03-17 21:31 by hmn_wj
[考研] 能源材料化学课题组招收硕士研究生8-10名 +3 脱颖而出 2026-03-16 6/300 2026-03-17 21:19 by z1z2z3879
[考研] 0703化学调剂 ，六级已过，有科研经历 +8 曦熙兮 2026-03-15 8/400 2026-03-17 20:31 by xilongliang
[考研] 299求调剂 +4 △小透明* 2026-03-17 4/200 2026-03-17 20:09 by peike
[考研] 085600材料与化工求调剂 +5 绪幸与子 2026-03-17 5/250 2026-03-17 16:40 by laoshidan
[考研] 085600材料与化工 +4 安全上岸！ 2026-03-16 4/200 2026-03-17 14:02 by 勇敢太监王公公
[考研] 275求调剂 +4 太阳花天天开心 2026-03-16 4/200 2026-03-17 10:53 by 功夫疯狂
[考研] 278求调剂 +3 Yy7400 2026-03-13 3/150 2026-03-17 08:24 by laoshidan
[考研] 一志愿，福州大学材料专硕339分求调剂 +3 木子momo青争 2026-03-15 3/150 2026-03-17 07:52 by laoshidan
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
[考研] 0856专硕279求调剂 +5 加油加油！? 2026-03-15 5/250 2026-03-15 11:58 by 2020015
[基金申请] 有必要更换申报口吗 20+3 fannyamoy 2026-03-11 3/150 2026-03-14 00:52 by zhanghaozhu
[考研] 0856材料与化工301求调剂 +5 奕束光 2026-03-13 5/250 2026-03-13 22:00 by 星空星月
[考研] 四川大学085601材料工程专硕 初试294求调剂 +4 祝我们好在冬天 2026-03-11 4/200 2026-03-13 21:39 by peike
[考研] 281求调剂 +9 Koxui 2026-03-12 11/550 2026-03-13 20:50 by Koxui
[考研] 311求调剂 +3 冬十三 2026-03-13 3/150 2026-03-13 20:41 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工085600调剂求老师收留 +9 jiaanl 2026-03-11 9/450 2026-03-13 20:22 by JourneyLucky
[考研] 295求调剂 +3 小匕仔汁 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:17 by vgtyfty
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭