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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » VASP中CI-NEB求过渡态出错
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阿克飞顿

金虫 (正式写手)

[求助] VASP中CI-NEB求过渡态出错 已有1人参与

通过bsub –q q_x86_kanglh –n 72 vasp提交任务,再通过bjobs查看任务进行状态，如图1
现在仍然这样
但是，打开log.txt文件时，（文件路径kanglh/zhaofei/TS1）文件开头显示如图2
任务目前显示还在计算中，我在求过渡态时在00和09之间插入了8个构象，
这是什么原因呢，是我的INCAR设置有问题还是提交任务所需核心数超出实际分配的核心数？
附件有我的INCAR文件和生成的log.txt文件。VASP中CI-NEB求过渡态出错
1.png


VASP中CI-NEB求过渡态出错-1
2.png
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  • 附件 1 : log.txt
    • 2015-07-16 13:09:43, 11.52 K
  • 附件 2 : INCAR
    • 2015-07-16 13:10:36, 2.52 K

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1楼 2015-07-16 13:09:53
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jpchou

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
阿克飞顿: 金币+3, ★有帮助 2015-07-17 16:59:48
可能你用了 NPAR = 4 ?

試試用 64 個 cores 去計算應該就可以了
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

阿克飞顿
2楼2015-07-16 15:34:05
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阿克飞顿

金虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by jpchou at 2015-07-16 15:34:05
可能你用了 NPAR = 4 ?

試試用 64 個 cores 去計算應該就可以了

谢谢，我把NPAR改成3就好了，可以正常计算了
赞一下 回复此楼
3楼2015-07-17 16:59:30
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阿克飞顿

金虫 (正式写手)
追问：NPAR改成3后，对资源里利用率有什么影响，会不会导致计算速度下降。比如我将NPAR改为9或者1都可以正常计算，但计算速度会有什么差别？？？
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4楼2015-07-17 17:01:48
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Am Melody

银虫 (小有名气)
楼主，你好。
请问你有编译CI-NEB的原始文件吗，或者介绍这个程序的相关的网站，求分享
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使沙漠显得美丽的，是它在什么地方藏着一口水井。
5楼2016-03-21 22:46:42
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luzihen

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by Am Melody at 2016-03-21 22:46:42
楼主，你好。
请问你有编译CI-NEB的原始文件吗，或者介绍这个程序的相关的网站，求分享

搜索vtst vasp neb
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6楼2016-03-25 15:07:50
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