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请教批量更改fasta序列名的方法? 已有5人参与
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在下正在做进化树,遇到了一个难题,故想请教各位大神,关于批量更改fasta序列名的方法? 如序列名: >A/Hong Kong/CUHK52247/2000 | 2000-12-08 | HA | 161173 | atgaagactatcattgctttgagctacattttatgtctggttttcgctcaaaaacttcccgtaaatgacaacagcacggc a...... >A/Hong Kong/CUHK21932/2001 | 2001-04-27 | HA | 161055 | atgaagactatcattgctttgagctacattttatgtctggttttcgctcaaaaacttccaggaaatgacaacagcactgc aac.... 删除名称的一部分我只想保留: >A/Hong Kong/CUHK52247/2000 atgaagactatcattgctttgagctacattttatgtctggttttcgctcaaaaacttcccgtaaatgacaacagcacggc a...... >A/Hong Kong/CUHK21932/2001 atgaagactatcattgctttgagctacattttatgtctggttttcgctcaaaaacttccaggaaatgacaacagcactgc aac.... 简而言之,就是fasta名称中的第一个“|”后的字符全部删除; 但是由于目前数据太多,一个一个来太慢了,就想请教大神们能不能批量修改了!先谢谢各位!!! |
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