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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 求助MIL-101、MIL53,MIL-88的CIF文件 谢谢！
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kuyeshizui

铜虫 (小有名气)

[求助] 求助MIL-101、MIL53,MIL-88的CIF文件 谢谢！ 已有1人参与

三种MOF结构的晶体数据CIF文件 谢谢了！
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1楼 2015-07-10 11:43:06
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卓鬼令

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
10楼: Originally posted by cluster8676 at 2015-12-17 10:45:58
记事本是没有另存为CIF, 可以你可以自己家上cif后缀。
另外，每一个结构可以单独存，也可以存一起。 关于MIL-88和 MIL-53, 我不知道具体的温度，我只是存下来了cif文件，那些文件名上这样写的。具体的还请参考文献 ...

楼主有没有，MIL-101(Cr)的CIF文件啊，我看了一下，小木虫中大多数都是不对的，我主要是想用DIamond画出笼状结构的。
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Come On
11楼2016-03-02 09:14:29
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laufe

铜虫 (初入文坛)
请问你找到MIL53的CIF文件了吗？
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2楼2015-09-02 20:23:13
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

MIL-88 三个结构

# Supplementary Material (ESI) for Chemical Communications
# This journal is ? The Royal Society of Chemistry 2005

data_global

_journal_coden_Cambridge         182

loop_
_publ_author_name
'Christian Serre'
'Gerard Ferey'
'Caroline Mellot-Draznieks'
'Franck Millange'
'Suzy Surble'

_publ_contact_author_name        'Christian Serre'
_publ_contact_author_address     
;
Charge de Recherches CNRS
Universite de Versailles St Quentin-en-Yvelines
Institut Lavoisier
43 Avenue des Etats-Unis
Versailles
78035
FRANCE
;

_publ_contact_author_email       SERRE@CHIMIE.UVSQ.FR

_publ_requested_journal          'Chemical Communications'

_publ_section_title              
;
An new isoreticular class of Metal-Organic-Frameworks
with the MIL-88 topology
;

data_su688n
_database_code_depnum_ccdc_archive 'CCDC 285810'
_audit_creation_method           'Created with Diamond v2.0'
_audit_creation_date             05-10-03
_audit_update_record             05-10-03
_chemical_formula_sum            'Cr6 O48 C58 N2'
_chemical_formula_weight         1804.596
_cell_length_a                   11.0282(10)
_cell_length_b                   11.0282(10)
_cell_length_c                   18.9717(10)
_cell_angle_alpha                90.000
_cell_angle_beta                 90.000
_cell_angle_gamma                120.000
_cell_volume                     1998.2(3)
_symmetry_int_tables_number      190
_symmetry_space_group_name_H-M   'P -6 2 c'
_symmetry_space_group_name_Hall  P_-6c_-2c

loop_
_atom_type_symbol
_atom_type_oxidation_number
_atom_type_radius_bond
Cr ? 1.200
O ? 0.660
C ? 0.860
N ? 0.800

loop_
_atom_site_label
_atom_site_type_symbol
_atom_site_fract_x
_atom_site_fract_y
_atom_site_fract_z
_atom_site_occupancy
_atom_site_symmetry_multiplicity
_atom_site_Wyckoff_symbol
_atom_site_attached_hydrogens
_atom_site_calc_flag
_atom_site_thermal_displace_type
_atom_site_u_iso_or_equiv
Cr Cr 0.2236 0.7628 0.7500 1.000 6 h ? d Uiso 0.00000
O1 O 0.3333 0.6667 0.7500 1.000 2 d ? d Uiso 0.00000
O2 O 0.3300 0.9040 0.6720 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
O3 O 0.1105 0.6331 0.6777 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
O4 O 0.0873 0.8226 0.7500 1.000 6 h ? d Uiso 0.00000
C1 C 0.0806 0.5250 0.6416 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
C2 C 0.5159 0.5013 0.4272 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
C3 C 0.3974 0.3968 0.4635 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
C4 C 0.6229 0.6093 0.4637 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
N1 C 0.7564 0.3668 0.7500 0.333 6 h ? d Uiso 0.00000
Cp2 N -0.2262 0.5355 0.7500 0.333 6 h ? d Uiso 0.00000
Cp3 C 0.5425 1.2542 0.6867 0.333 12 i ? d Uiso 0.00000
Cp4 C 0.6831 0.3677 0.6873 0.333 12 i ? d Uiso 0.00000
Ow1 O -0.1174 0.8177 0.8289 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
Ow2 O 0.0000 0.0000 0.4326 1.000 4 e ? d Uiso 0.00000

data_d53
_database_code_depnum_ccdc_archive 'CCDC 285811'
_audit_creation_method           'Created with Diamond v2.0'
_audit_creation_date             05-10-03
_audit_update_record             05-10-03
_chemical_formula_sum            'Cr6 O50 C84 N56'
_chemical_formula_weight         2905.245
_cell_length_a                   12.1647(10)
_cell_length_b                   12.1647(10)
_cell_length_c                   27.1971(10)
_cell_angle_alpha                90.000
_cell_angle_beta                 90.000
_cell_angle_gamma                120.000
_cell_volume                     3485.4(4)
_symmetry_int_tables_number      190
_symmetry_space_group_name_H-M   'P -6 2 c'
_symmetry_space_group_name_Hall  P_-6c_-2c

loop_
_atom_type_symbol
_atom_type_oxidation_number
_atom_type_radius_bond
Cr ? 1.200
O ? 0.660
C ? 0.860
N ? 0.800

loop_
_atom_site_label
_atom_site_type_symbol
_atom_site_fract_x
_atom_site_fract_y
_atom_site_fract_z
_atom_site_occupancy
_atom_site_symmetry_multiplicity
_atom_site_Wyckoff_symbol
_atom_site_attached_hydrogens
_atom_site_calc_flag
_atom_site_thermal_displace_type
_atom_site_u_iso_or_equiv
Cr Cr 0.8131 0.3004 0.2500 1.000 6 h ? d Uiso 0.00000
O1 O 0.6667 0.3333 0.2500 1.000 2 d ? d Uiso 0.00000
O2 O 0.5505 0.1182 0.1982 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
O3 O 0.7406 0.1529 0.1989 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
O4 O 0.6917 -0.3371 0.2500 1.000 6 h ? d Uiso 0.00000
C1 C 0.6417 0.1254 0.1788 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
C2 C 0.3715 0.4621 -0.1265 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
C3 C 0.3701 0.5466 -0.0882 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
C4 C 0.3598 0.5054 -0.0374 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
C5 C 0.3958 0.4160 -0.0259 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
C6 C 0.3782 0.3284 -0.0588 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
C7 C 0.3371 0.3390 -0.1073 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
Ow1 O 1.0000 1.0000 0.2500 1.000 2 b ? d Uiso 0.00000
Ow2 O 0.6667 0.3333 -0.0381 1.000 4 f ? d Uiso 0.00000
Ow3 O 0.6065 0.4951 -0.0826 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
X1 N 0.6667 0.3333 -0.2209 1.000 4 f ? d Uiso 0.00000
X2 N 0.8505 0.7429 -0.1610 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
X3 N 1.0327 0.9125 -0.0225 0.500 12 i ? d Uiso 0.00000
X4 N 0.7216 0.6808 -0.1346 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
X5 N 0.0000 0.0000 0.4469 1.000 4 e ? d Uiso 0.00000
X6 N 1.1011 0.0000 0.0000 1.000 6 g ? d Uiso 0.00000
X7 N 0.8713 0.1260 -0.2157 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000

data_CS571
_database_code_depnum_ccdc_archive 'CCDC 285812'
_audit_creation_method           'Created with Diamond v2.0'
_audit_creation_date             05-10-03
_audit_update_record             05-10-03
_chemical_formula_sum            'Fe6 O46.4 C90.4'
_chemical_formula_weight         2163.245
_cell_length_a                   10.1751(10)
_cell_length_b                   10.1751(10)
_cell_length_c                   23.7722(10)
_cell_angle_alpha                90.000
_cell_angle_beta                 90.000
_cell_angle_gamma                120.000
_cell_volume                     2131.5(3)
_symmetry_int_tables_number      190
_symmetry_space_group_name_H-M   'P -6 2 c'
_symmetry_space_group_name_Hall  P_-6c_-2c

loop_
_atom_type_symbol
_atom_type_oxidation_number
_atom_type_radius_bond
Fe ? 1.200
O ? 0.660
C ? 0.860

loop_
_atom_site_label
_atom_site_type_symbol
_atom_site_fract_x
_atom_site_fract_y
_atom_site_fract_z
_atom_site_occupancy
_atom_site_symmetry_multiplicity
_atom_site_Wyckoff_symbol
_atom_site_attached_hydrogens
_atom_site_calc_flag
_atom_site_thermal_displace_type
_atom_site_u_iso_or_equiv
Fe Fe 0.7271 0.1639 0.2500 1.000 6 h ? d Uiso 0.00000
O1 O 0.6667 0.3333 0.2500 1.000 2 d ? d Uiso 0.00000
O2 O 0.3972 0.1245 0.1894 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
O3 O 0.5729 0.0683 0.1916 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
O4 O 0.9674 -0.2259 0.2500 1.000 6 h ? d Uiso 0.00000
Oac O 0.2349 0.5304 0.1646 0.333 12 i ? d Uiso 0.00000
C1 C -0.5370 0.0813 0.1037 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
C2 C -0.5656 0.0652 -0.1023 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
C3 C -0.4771 0.1356 -0.0582 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
C4 C -0.5400 0.0762 -0.0017 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
C5 C -0.6340 -0.1531 -0.0490 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
C6 C 0.5159 0.1397 0.1662 1.000 12 i ? d Uiso 0.00000
C7 C 0.1372 0.2115 0.2946 0.500 12 i ? d Uiso 0.00000
Cac1 C 0.4076 -0.2308 0.2500 0.333 6 h ? d Uiso 0.00000
Cac2 C 0.2193 0.6340 0.1863 0.167 12 i ? d Uiso 0.00000
Ow O 0.0000 0.0000 0.0000 1.000 2 a ? d Uiso 0.00000
Om O 0.1111 0.1425 0.4001 0.700 12 i ? d Uiso 0.00000
Cm C 0.2336 0.1784 0.0607 0.700 12 i ? d Uiso 0.00000
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学无止境
3楼2015-09-03 02:58:53
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

MIL-53 As synthesized


#######################################################################
#
#                 Cambridge Crystallographic Data Centre
#                                CCDC
#
#######################################################################
#
# If this CIF has been generated directly or indirectly from an entry in the
# Cambridge Structural Database, then it will include bibliographic, chemical,
# crystal, experimental, refinement or atomic coordinate data resulting from
# the CCDC's data processing and validation procedures. Files generated from
# CSD entries are Copyright 2013 Cambridge Crystallographic Data Centre. They
# may be used in bona fide research applications only, and may not be copied or
# further disseminated in any form, whether machine-readable or not, except for
# the purposes of generating routine backup copies on your local computer
# system.
#
# Files arising from any other source may also contain material that is the
# copyright of third parties, including the originator, and you should check
# with the originator concerning the permitted uses of the information
# contained in this CIF.
#
# For further information on the CCDC and the free tools enCIFer and Mercury
# for validating and visualising CIF files, please visit www.ccdc.cam.ac.uk
#
#######################################################################

data_MINVOU01
_audit_creation_date             2003-05-28
_database_code_depnum_ccdc_archive 'CCDC 797262'
_database_code_NBS               795191
_chemical_name_common            MIL-53as
_chemical_formula_moiety         '(C8 H5 Cr1 O5)4n,3n(C8 H6 O4)'
_chemical_name_systematic        
'catena-(tetrakis((\m~4~-1,4-Benzenedicarboxylato)-(\m~2~-hydroxo)-chromium(iii)) tris(1,4-benzenedicarboxylic acid) clathrate)'
_journal_coden_Cambridge         4
_journal_volume                  124
_journal_year                    2002
_journal_page_first              13519
_journal_name_full               J.Am.Chem.Soc.
loop_
_publ_author_name
C.Serre
F.Millange
C.Thouvenot
M.Nogues
G.Marsolier
D.Louer
G.Ferey
_chemical_absolute_configuration unk
_diffrn_ambient_temperature      296
_exptl_crystal_density_meas      1.65
_exptl_crystal_density_diffrn    1.649
#These two values have been output from a single CSD field.
_refine_ls_R_factor_gt           0.119
_refine_ls_wR_factor_gt          0.119
_diffrn_radiation_probe          x-ray
_symmetry_cell_setting           orthorhombic
_symmetry_space_group_name_H-M   'P n a m'
_symmetry_Int_Tables_number      62
loop_
_symmetry_equiv_pos_site_id
_symmetry_equiv_pos_as_xyz
1 x,y,z
2 -x,-y,1/2+z
3 1/2+x,1/2-y,1/2-z
4 1/2-x,1/2+y,-z
5 -x,-y,-z
6 x,y,1/2-z
7 1/2-x,1/2+y,1/2+z
8 1/2+x,1/2-y,z
_cell_length_a                   17.340(1)
_cell_length_b                   12.178(1)
_cell_length_c                   6.822(1)
_cell_angle_alpha                90
_cell_angle_beta                 90
_cell_angle_gamma                90
_cell_volume                     1440.58
_cell_formula_units_Z            1
loop_
_atom_site_label
_atom_site_type_symbol
_atom_site_fract_x
_atom_site_fract_y
_atom_site_fract_z
C7 C 0.032(2) 0.309(3) -0.250
C8 C 0.133(4) 0.535(4) -0.051(2)
C9 C 0.144(3) 0.451(3) -0.250
C10 C 0.138(2) 0.473(2) 0.134(3)
C11 C 0.034(2) 0.350(3) 0.250
C12 C 0.032(2) 0.369(2) 0.043(4)
C13 C 0.101(1) 0.405(2) -0.013(6)
C14 C 0.046(3) 0.425(3) -0.190(1)
C14E C 0.046 0.425 -0.31
C8E C 0.133 0.535 -0.449
C10E C 0.138 0.473 0.366
C12E C 0.032 0.369 0.457
C12E C 0.032 0.369 -0.543
C13E C 0.101 0.405 -0.487
C10E C 0.138 0.473 -0.634
C8E C 0.133 0.535 0.551
C13E C 0.101 0.405 0.513
C14E C 0.046 0.425 0.69
Cr1 Cr 0.000 0.000 0.000
O1 O 0.002(2) -0.078(1) -0.250
O2 O 0.089(1) 0.089(1) -0.087(2)
O3 O 0.427(1) 0.388(1) -0.090(2)
C1 C 0.392(2) 0.357(3) -0.250
C2 C 0.123(2) 0.117(4) -0.250
C3 C 0.329(2) 0.287(3) -0.250
C4 C 0.191(2) 0.180(4) -0.250
C5 C 0.229(1) 0.198(2) -0.078(2)
C6 C 0.295(1) 0.264(2) -0.080(2)
O3E O 0.427 0.388 -0.41
O2E O 0.089 0.089 -0.413
C6E C 0.295 0.264 -0.42
C5E C 0.229 0.198 -0.422
O1A O -0.002 0.078 0.25
O2D O -0.089 -0.089 0.087
O3C O 0.073 -0.112 0.09
Cr1A Cr 0 0 -0.5
O3G O -0.073 0.112 -0.09
Cr1C Cr 0.5 0.5 0
Cr1B Cr 0.5 0.5 -0.5

#END
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学无止境
4楼2015-09-03 02:59:59
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