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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 请教DPD计算界面张力问题
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qyshang1989

新虫 (小有名气)
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10楼: Originally posted by lsloneil at 2015-07-10 10:57:39
"自由能密度泛函理论应该就是您说的液体理论里的DFT吧？"
是。

我不清楚你到底想算什么，一会儿在MS里跑DPD，一会儿又想着DFT，一会儿又想用gromacs。

流体DFT不属于分子模拟范畴，而是计算液体结 ...

谢谢指导，我是想用溶液理论中的DFT和状态方程结合，计算混合物的界面张力，但不知道用哪个软件算好？能指点一下吗？课题组内没有人算过，有点无从下手啊
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11楼2015-07-10 12:55:00
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)
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11楼: Originally posted by qyshang1989 at 2015-07-09 16:55:00
谢谢指导，我是想用溶液理论中的DFT和状态方程结合，计算混合物的界面张力，但不知道用哪个软件算好？能指点一下吗？课题组内没有人算过，有点无从下手啊...

我没做过DFT。如我之前所说的，流体DFT没有一个通用的软件，很多课题组都有自己的代码，你可以联系相关课题组的负责人看他们是否愿意给你他们的代码。网上也可能有一些流体DFT的开源软件，需要你自己去搜索，比如这个
https://software.sandia.gov/tramonto/index.html

DFT从理论学习到上手都需要一段时间。个人觉得如果你已经有界面模拟的数据就应该想尽一切办法从这些数据中计算表面张力，这不是很困难的事情，一般来讲只要知道了压力张量在xx,yy,zz上的分量就可以计算表面张力，多看一下相关文献和软件的手册看别人是怎么处理数据的，人丑就要多读书。
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qyshang1989
12楼2015-07-11 05:21:18
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qyshang1989

新虫 (小有名气)
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13楼2015-07-11 09:18:25
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xiaochong8693

木虫之王 (文坛精英)
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qyshang1989: 金币+1 2015-07-11 13:23:42
为楼主留下满满的祝福
祝福楼主和各位虫友事事如意，梦想成真！
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14楼2015-07-11 10:15:11
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吴雷wulei
★
qyshang1989: 金币+1 2015-07-11 14:21:05
15楼2015-07-11 10:31:44
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8wangle
★
qyshang1989: 金币+1 2015-07-11 14:21:08
16楼2015-07-11 10:39:46
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
qyshang1989: 金币+6 2015-07-11 14:20:01
引用回帖:
13楼: Originally posted by qyshang1989 at 2015-07-10 13:18:25
谢谢，我要算的体系文献上的方法就是DFT和状态方程结合，或着Monte Carlo模拟，或者简单的数据回归（这个老师说理论深度不够），我的实验数据已经采集完了，现在就是要计算了。
您讲的这个“压力张量在xx,yy,zz上 ...

你这人怎么老是做伸手党啊？自己搜一下material studio surface tension就会有东西出来。比如这个

http://accelrys.com/events/webin ... 20(NXPowerLite).pdf

参见第29张幻灯片。

或者参考这篇文献
http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/la702286h

Method部分中的公式。

简而言之如果垂直于界面的方向定为z轴，需要计算的量就是压力张量在xx, yy, zz 方向上的分量，然后表面张力
\gamma = (P_zz - 0.5*(P_xx + P_yy ) )*L_z

L_z is the box length in z direction.

至于你怎么从MS的输出中提取压力张量在xx, yy, zz 方向上的分量请你自己研究吧，我没用过MS，只能帮你到这里。
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17楼2015-07-11 11:33:47
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qyshang1989

新虫 (小有名气)
引用回帖:
17楼: Originally posted by lsloneil at 2015-07-11 11:33:47
你这人怎么老是做伸手党啊？自己搜一下material studio surface tension就会有东西出来。比如这个

http://accelrys.com/events/webinars/materials-studio-50/Webinar_MS50_Polymers%20(NXPowerLite).pdf

参 ...

非常感谢您的指导和帮助，我再自己研究一下，请楼上体谅“伸手党”的追问，由于时间紧迫（只有半年的时间计算，还没有基础，无人指导），感觉小木虫上高手比较多，所以在此发起此贴，感谢所有回帖的高手！

感谢楼上抽出时间耐心回答我的问题！

最后还是谢谢大家！
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18楼2015-07-11 14:19:02
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