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用Kmer预测的基因组大小和allpathlg组装的基因组大小存在明显差异
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组装的是海藻的基因组 用Kmer=17进行预测大小后发现，和组装的结果存在明显差异 The genome size estimated: by P(x): 32081574 by F(x): 30124254 by P(x) and F(x): 31072120 上面是gce的kmer_freq_pread的结果 77060657 total contig length 83215068 total scaffold length, with gaps 这是allpathlg组装的结果 是海藻基因组就是这样还是因为测序数据有问题呢？ |
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