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fogmoon

金虫 (小有名气)

Dr.

[交流] 新人求问,怎么样改原子编号方便,做qst2时需要的 已有2人参与

lz新人,正在学习如何找过渡态,试着建立qst2的时候发现有的时候两个结构之间的原子编号全打乱了,GaussView里没找到相关的修改功能,只能自己改坐标,感觉挺麻烦的。
问问各位前辈这样的问题都是怎么解决的,如何快速改原子编号,或者说如何快速地让qst2的两个分子的各个原子编号对应起来?
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nevergiveup
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oinkmasta

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gmy1990: 金币+2, 感谢应助 2015-07-07 03:54:39
Gview 里面有的。在显示分子的窗口中右击选择 Edit--Atom List,进去改编号就行了。还可以选择高亮来确定是不是对应的原子。
16届本科在北美
2楼2015-07-05 22:53:21
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oinkmasta

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
补充以下,如果两个构型间要修改的不多,也可以直接保存其中一个,通过改键长键角之类做成第二个构型。这样改出来的原子编号都是对应好了的。
16届本科在北美
3楼2015-07-05 22:55:51
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smutao

禁虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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4楼2015-07-07 01:42:10
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fogmoon

金虫 (小有名气)

Dr.

引用回帖:
2楼: Originally posted by oinkmasta at 2015-07-05 22:53:21
Gview 里面有的。在显示分子的窗口中右击选择 Edit--Atom List,进去改编号就行了。还可以选择高亮来确定是不是对应的原子。

我只会用笨办法,就是把原子A的坐标xyz分别复制到最下面的空格子,然后把B的坐标复制到A里,最后在把空白格子的坐标复制到B里,经过6次ctrl+C Ctrl+V的操作,经常会操作错。gview改编号有没有简单的方法呢,没有的话我还是查查代码写个脚本好了
nevergiveup
5楼2015-07-25 23:49:26
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