| 查看: 273 | 回复: 1 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
| 【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 swordzj858 的 1 个金币 | |||
swordzj858至尊木虫 (著名写手)
|
[交流]
【求助】autodock4.0中受体文件的准备
|
||
| 请教各位高手，在用autodock4.0进行对接时，在受体文件的准备工作中发现从Protein Data Bank中下载的蛋白质pdb文件通常含有金属离子（如Mg），SO4等，请问应该如何处理，另外在Grid Box中的参数设定的原则是什么？请大家不吝赐教。 |
回复此楼» 猜你喜欢
什么时候开奖？
已经有13人回复
-
散金币祈福
已经有94人回复
-
物理学I论文润色/翻译怎么收费?
已经有131人回复
-
青基已中
已经有1人回复
-
散金币祈福
已经有186人回复
-
求助，如何提取ELK的rt-TDDFT在某一时刻的自旋密度分布和电子密度分布
已经有1人回复
-
澳门大学IAPME李海峰教授常年招收博士研究生
已经有0人回复
-
澳门大学IAPME李海峰教授常年招收博士研究生
已经有0人回复
-
澳门大学IAPME李海峰教授常年招收博士研究生
已经有0人回复
-
求助中医院临床中医中标的青年标书学习，谢谢
已经有3人回复
★ ★ ★ ★
swordzj858(金币+4,VIP+0):非常感谢
swordzj858(金币+4,VIP+0):非常感谢
|
useing autodock4 with ADT a tutorial.pdf 上面有一步一步的教程 autodock 网站上有的下载， google上也能搜索得到吧 1 用ADT 或者sybyl,ds2, viewerPro ,pymol或者 干脆editplus 删掉水分子和离子如 SO4 和你配体分子 2 grid box 一般以配体为中心吧， center on the ligand 好像， 然后 三个 方向 个 60 格点一般， 要包含配体，可以根据蛋白口袋形状和配体大小具体调整某一方向的大小， 间距 spacing 0.375 angstron 默认就行 |
2楼2008-07-31 13:31:17