应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 通过SCAN二面角寻找顺反异构过渡态初值，但搜索过程中两个原子重合了，求助？
51/1返回列表
查看: 2766  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

luckyyjjun

铁虫 (正式写手)

[求助] 通过SCAN二面角寻找顺反异构过渡态初值，但搜索过程中两个原子重合了，求助？ 已有1人参与

研究顺-2-丁烯异构化为反-2-丁烯的过程，通过scan连接双击的二面角研究二面角在旋转过程中体系能量的变化，从而确定过渡态。但是scan完毕后发现二面角并不按照预想的方式旋转，而且体系能量一直上升。输入文件如下：
%nprocshared=2
%chk=D:\gaussian work\2-Butene\SCAN-CIS-2-BUTENE.chk
#p scan rhf/3-21g geom=connectivity

Title Card Required

0 1
C              
C                  1            B1
H                  1            B2    2            A1
H                  1            B3    2            A2    3            D1    0
H                  1            B4    2            A3    3            D2    0
C                  2            B5    1            A4    5            D3    0
H                  2            B6    1            A5    6            D4    0
C                  6            B7    2            A6    1            D5    0
H                  6            B8    2            A7    1            D6    0
H                  8            B9    6            A8    2            D7    0
H                  8           B10    6            A9    2            D8    0
H                  8           B11    6           A10    2            D9    0

   B1             1.51006675
   B2             1.08611348
   B3             1.08606428
   B4             1.08361226
   B5             1.31642102
   B6             1.07705901
   B7             1.51006683
   B8             1.07705894
   B9             1.08611778
   B10            1.08605894
   B11            1.08361220
   A1           110.76697387
   A2           110.77291043
   A3           111.18065053
   A4           124.74935835
   A5           115.77071885
   A6           124.74934680
   A7           119.47973594
   A8           110.77227638
   A9           110.76759964
   A10          111.18063418
   D1           119.11929795
   D2          -120.43449957
   D3             0.03524097
   D4           179.85821986
   D5          -179.98790130 170 1.0
   D6            -0.13517961
   D7           120.33408082
   D8          -120.54663055
   D9            -0.10348842

1 2 1.0 3 1.0 4 1.0 5 1.0
2 6 2.0 7 1.0
3
4
5
6 8 1.0 9 1.0
7
8 10 1.0 11 1.0 12 1.0
9
10
11
12
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : SCAN-CIS-2-BUTENE.LOG
    • 2015-06-29 16:28:17, 2.78 M

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-06-29 16:29:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

keyares

铁杆木虫 (著名写手)
键在旋转的过程中双键的键长和能量也会发生变化。我觉得找过渡态的策略上要改变一下。

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
5楼2015-07-01 14:15:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

oinkmasta

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
按理不该有原子重合呀，我猜确实是“二面角不按照预想的方式旋转”。
2-butene很小的，用opt=modredundant做个柔性扫描好了。（记得加扫描的那一行）
赞一下 回复此楼
16届本科在北美
2楼2015-06-30 04:13:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luckyyjjun

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by oinkmasta at 2015-06-30 04:13:19
按理不该有原子重合呀，我猜确实是“二面角不按照预想的方式旋转”。
2-butene很小的，用opt=modredundant做个柔性扫描好了。（记得加扫描的那一行）

柔性扫描不行
回复此楼
3楼2015-07-01 01:02:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

keyares

铁杆木虫 (著名写手)
我最近也在做这个实验。寻找s顺反的过渡态。我先锁定二面角为90度优化。然后计算过渡态。然后频率计算得到一个虚频。不过我用的是半经验的方法

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
4楼2015-07-01 14:12:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 基金啊基金 +3 longfie172 2026-08-20 3/150 2026-08-21 00:04 by wuchongjun
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +8 大萍1987 2026-08-20 10/500 2026-08-20 21:48 by 大萍1987
[基金申请] 言之凿凿，明天官网会通知放榜？ +15 医学老男孩 2026-08-20 17/850 2026-08-20 20:35 by CaoLG
[基金申请] 时间戳又变了 +12 wuchongjun 2026-08-20 17/850 2026-08-20 20:05 by spzhao
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 时间戳变了，能看出什么问题？ +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +21 yaoyewhu2008 2026-08-20 22/1100 2026-08-20 17:03 by yaoyewhu2008
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+3 snowwithsea 2026-08-19 12/600 2026-08-20 15:56 by lfy8008
[基金申请] 重要消息，中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低？主要原因有哪些？ +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +4 yuleib84 2026-08-19 5/250 2026-08-19 19:52 by hhs666
[基金申请] 今天放榜吗？ +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 什么时候开奖？ +6 CrisMessi 2026-08-18 6/300 2026-08-19 08:06 by Equinoxhua
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[精细化工] 招聘 金属平磨液，抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭