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【求助】用SYBYL7.3的FlexX做分子对接!(请大侠们不吝赐教,不胜感激)
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按Docking suite Manual——Single Molecule Docking with FlexX操作时,做到2.2.3 Check and Modify the Ligand's Atom and Bond Types的 2.One problem remains:the carbonyl group should be a C-OH group.This modification must be done manually.项下的Select the 2 atoms in the carbonyl group and press OK in the dialog.步骤时,不知如何操作(该选哪两个原子,最好能指出选择依据和原子符号,请各位大侠不吝赐教,帮我一把,不胜感激)。 随便选择原子或忽略上步骤时,按下一步骤Specify the new atom types as follows:carbon:C3 and press OK.oxygen:O3 and press OK.会弹出对话框 Atoms outside of the ligand seleced. Please select only atoms in the ligand.请问问题究竟出在哪里,请各位大侠白忙之中不吝赐教,不胜感激! [ Last edited by zzgyb on 2008-7-31 at 08:19 ] |
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