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swordzj858至尊木虫 (著名写手)
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【求助】Autodock4最后一步Run AotuDock出现问题
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各位高手，我在用Windows版的autodock4做对接时，一直进行到生成*.dpf文件时都比较正常，打开*.dpf文件也没发现问题。但是当我进行Run-AutoDock4出现得到的*.dlg文件很小，只有34KB,正常的有740KB（我重复教程中的实例） 分别打开两个*.dlg文件发现正常的有195页，我得到的只有22页，而且出现如下错误： /cygdrive/c/Documents and Settings/ZhangJie/local/bin/autodock4: ERROR: insufficient grid points. /cygdrive/c/Documents and Settings/ZhangJie/local/bin/autodock4: Aborting... /cygdrive/c/Documents and Settings/ZhangJie/local/bin/autodock4: Unsuccessful Completion. 请问是怎么回事？ |
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6楼2008-07-30 12:40:38
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autodock4的问题
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非常感谢您的帮助，按照您的提示，我把autodock4直接安装在了另外一个盘符下面（M：盘），但是当运行 cp autodock4.exe /usr/local/bin cp autogrid4.exe /usr/local/bin 后，没有生成local文件夹，我用M:\autodocksuite-4.0.1\bin\i86Cygwin下的autodoc4.exe运行run-autodock时还是出现了这个问题，提示： DPF> fld hsg1_rigid.maps.fld # grid_data_file /cygdrive/m/autodocksuite-4.0.1/bin/i86Cygwin/autodock4: I'm sorry; I can't find or open "hsg1_rigid.maps.fld" ________________________________________________________________________________ /cygdrive/m/autodocksuite-4.0.1/bin/i86Cygwin/autodock4: I'm sorry; I can't find or open "hsg1_rigid.maps.fld" Real= 0.12, CPU= 0.09, System= 0.00 我的文件夹下面含有hsg1_rigid.maps.fld这个文件。请您不吝赐教！非常感谢！ |
3楼2008-07-29 21:43:55
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zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
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你说的“ cp autodock4.exe /usr/local/bin cp autogrid4.exe /usr/local/bin 后，没有生成local文件夹”是什么意思？ 我的意思是这样： cd M:\autodocksuite-4.0.1\bin\i86Cygwin mkdir test cp autodock4 and all your other docking files to this dir cd test ./autodock4 -p aaa.dpf -l aaa.dlg& 看看这样行不？ |
4楼2008-07-30 09:23:03
