| 查看: 1394 | 回复: 5 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
swordzj858至尊木虫 (著名写手)
|
[交流]
【求助】Autodock4最后一步Run AotuDock出现问题
|
||
|
各位高手，我在用Windows版的autodock4做对接时，一直进行到生成*.dpf文件时都比较正常，打开*.dpf文件也没发现问题。但是当我进行Run-AutoDock4出现得到的*.dlg文件很小，只有34KB,正常的有740KB（我重复教程中的实例） 分别打开两个*.dlg文件发现正常的有195页，我得到的只有22页，而且出现如下错误： /cygdrive/c/Documents and Settings/ZhangJie/local/bin/autodock4: ERROR: insufficient grid points. /cygdrive/c/Documents and Settings/ZhangJie/local/bin/autodock4: Aborting... /cygdrive/c/Documents and Settings/ZhangJie/local/bin/autodock4: Unsuccessful Completion. 请问是怎么回事？ |
回复此楼» 猜你喜欢
重庆交大26年硕士生招生拟调剂通知已出！欢迎加入光子学微结构与器件课题组。
已经有0人回复
-
UJN物理学专业调剂
已经有12人回复
-
物理学I论文润色/翻译怎么收费?
已经有247人回复
-
北京纳米能源与系统研究所王中林院士/曹南颖研究员课题组招收2026硕士研究生1名
已经有0人回复
-
山西大同大学物理学硕士研究生招收调剂生
已经有0人回复
-
[调剂信息]211智能人工感知方向国家青年特聘专家课题组招收调剂研究生
已经有0人回复
-
［调剂信息］211智能人工感知方向国家青年特聘专家课题组招收调剂研究生
已经有0人回复
-
[调剂信息]211智能人工感知方向国家青年特聘专家课题组招收调剂研究生
已经有0人回复
-
一志愿物理所凝聚态物理352求调剂
已经有0人回复
-
0702一志愿吉大B区求调剂 本科期间发表一篇Sci
已经有0人回复
gwdavid
木虫 (著名写手)
小木虫散兵坑坑长
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 0.522
- 金币: 4097.7
- 散金: 1548
- 红花: 57
- 帖子: 1768
- 在线: 151.2小时
- 虫号: 514002
- 注册: 2008-02-28
- 性别: GG
- 专业: 生化分析及生物传感
★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
|
你说的“ cp autodock4.exe /usr/local/bin cp autogrid4.exe /usr/local/bin 后，没有生成local文件夹”是什么意思？ 我的意思是这样： cd M:\autodocksuite-4.0.1\bin\i86Cygwin mkdir test cp autodock4 and all your other docking files to this dir cd test ./autodock4 -p aaa.dpf -l aaa.dlg& 看看这样行不？ |
4楼2008-07-30 09:23:03
gwdavid
木虫 (著名写手)
小木虫散兵坑坑长
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 0.522
- 金币: 4097.7
- 散金: 1548
- 红花: 57
- 帖子: 1768
- 在线: 151.2小时
- 虫号: 514002
- 注册: 2008-02-28
- 性别: GG
- 专业: 生化分析及生物传感
2楼2008-07-29 20:42:16
swordzj858
至尊木虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 17716.7
- 散金: 3626
- 红花: 6
- 帖子: 2107
- 在线: 766.6小时
- 虫号: 477105
- 注册: 2007-12-13
- 性别: GG
- 专业: 药物化学
autodock4的问题
|
非常感谢您的帮助，按照您的提示，我把autodock4直接安装在了另外一个盘符下面（M：盘），但是当运行 cp autodock4.exe /usr/local/bin cp autogrid4.exe /usr/local/bin 后，没有生成local文件夹，我用M:\autodocksuite-4.0.1\bin\i86Cygwin下的autodoc4.exe运行run-autodock时还是出现了这个问题，提示： DPF> fld hsg1_rigid.maps.fld # grid_data_file /cygdrive/m/autodocksuite-4.0.1/bin/i86Cygwin/autodock4: I'm sorry; I can't find or open "hsg1_rigid.maps.fld" ________________________________________________________________________________ /cygdrive/m/autodocksuite-4.0.1/bin/i86Cygwin/autodock4: I'm sorry; I can't find or open "hsg1_rigid.maps.fld" Real= 0.12, CPU= 0.09, System= 0.00 我的文件夹下面含有hsg1_rigid.maps.fld这个文件。请您不吝赐教！非常感谢！ |
3楼2008-07-29 21:43:55
swordzj858
至尊木虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 17716.7
- 散金: 3626
- 红花: 6
- 帖子: 2107
- 在线: 766.6小时
- 虫号: 477105
- 注册: 2007-12-13
- 性别: GG
- 专业: 药物化学
5楼2008-07-30 10:34:30
