应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » [求助]分子动力学优化结构的步骤
51/1返回列表
查看: 1311  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

bioinflab

银虫 (小有名气)

[交流] [求助]分子动力学优化结构的步骤

从文献上看到，利用同源模建预测蛋白质结构后，还需要做分子动力学优化。请问在做分子动力学之前需要做能量极小化吗？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2008-07-27 23:00:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

anquren

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by renwenpo at 2008-7-28 09:22:
需要,在建模后进行最小化计算来优化结构和使能量最小化

还需要别的步骤吗?
赞一下 回复此楼
5楼2008-09-04 00:05:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

renwenpo

金虫 (小有名气)
★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
需要,在建模后进行最小化计算来优化结构和使能量最小化
赞一下(10人) 回复此楼
2楼2008-07-28 09:22:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bioinflab

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by renwenpo at 2008-7-28 09:22:
需要,在建模后进行最小化计算来优化结构和使能量最小化

拟按照下列步骤:：1、能量极小化，2、分子动力学，3、选取最低能量的构象再进行能量极小化。
请问，这样的步骤可以吗？
赞一下 回复此楼
3楼2008-07-28 18:48:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jilinjohn

至尊木虫 (著名写手)
你说的应该是标准步骤了 呵呵
赞一下 回复此楼
http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=696776&view=old
4楼2008-07-29 08:16:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭