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wangxiao209761

木虫 (小有名气)

[交流] 求助:关于引物设计

求教:在小麦中的一个基因的引物,能否用做水稻的同一个基因引物呢?如果能的话,可以省去引物的设计了!(可能问题有点外行,初涉这个专业,望多多指导!)

[ Last edited by 350784478 on 2009-7-16 at 20:37 ]
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

假如引物结合区域刚好是该基因的高度保守区(在小麦与水稻中保守),估计还是行的
但是,一般还是自行设计啦~~~设计个引物能有多难……
2楼2008-07-27 15:57:00
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

BSP这种难度属于变态级别的引物都能有相应的策略设计出来,其他引物都不是什么太大的问题,只要知道该基因的序列~~
3楼2008-07-27 15:57:58
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wangxiao209761

木虫 (小有名气)

谢谢啊!我是这方面的门外汉,但是老板的课题要加入这部分内容,我想找捷径,三磷酸腺苷顺便给推荐个好的引物设计软件吧,十分感谢!
4楼2008-07-27 16:05:35
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

最经典的就是Prime Primer 5了
前几天貌似有人在论坛上发了这个软件
Google一下也有,太经典了
5楼2008-07-27 16:44:41
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iamrohy

银虫 (初入文坛)

你拿序列去NCBI上的BLAST的水稻基因组中去比对一下,看一下它们的同源性如何,尤其要看你设计引物的那段序列的同源性
最主要的是看这两个基因的匹配度是否很高
多俗呀,不写了
6楼2008-07-27 16:50:10
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wangxiao209761

木虫 (小有名气)

非常感谢!以后有问题还要请教大家啊!
7楼2008-07-27 16:56:45
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