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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 求助：关于引物设计
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wangxiao209761

木虫 (小有名气)

[交流] 求助：关于引物设计

求教：在小麦中的一个基因的引物，能否用做水稻的同一个基因引物呢？如果能的话，可以省去引物的设计了！（可能问题有点外行，初涉这个专业，望多多指导！）

[ Last edited by 350784478 on 2009-7-16 at 20:37 ]
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1楼 2008-07-27 15:04:59
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
假如引物结合区域刚好是该基因的高度保守区（在小麦与水稻中保守），估计还是行的
但是，一般还是自行设计啦~~~设计个引物能有多难……
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2楼2008-07-27 15:57:00
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
BSP这种难度属于变态级别的引物都能有相应的策略设计出来，其他引物都不是什么太大的问题，只要知道该基因的序列~~
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3楼2008-07-27 15:57:58
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wangxiao209761

木虫 (小有名气)
谢谢啊！我是这方面的门外汉，但是老板的课题要加入这部分内容，我想找捷径，三磷酸腺苷顺便给推荐个好的引物设计软件吧，十分感谢！
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4楼2008-07-27 16:05:35
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
最经典的就是Prime Primer 5了
前几天貌似有人在论坛上发了这个软件
Google一下也有，太经典了
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5楼2008-07-27 16:44:41
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iamrohy

银虫 (初入文坛)
你拿序列去NCBI上的BLAST的水稻基因组中去比对一下，看一下它们的同源性如何，尤其要看你设计引物的那段序列的同源性
最主要的是看这两个基因的匹配度是否很高
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多俗呀，不写了
6楼2008-07-27 16:50:10
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wangxiao209761

木虫 (小有名气)
非常感谢！以后有问题还要请教大家啊！
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7楼2008-07-27 16:56:45
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