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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 分子间氢键
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丫丫兮兮1991

新虫 (初入文坛)

[求助] 分子间氢键 已有1人参与

最近在算两个分子间氢键的键能，但在优化这两个分子体系的时候，老是出现L502错误，我觉得应该是这两个分子间的构型摆的不对，不知道大家有没有什么快速摆对分子构型的方法，急求呀！！！！！！
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1楼 2015-06-16 17:19:44
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
丫丫兮兮1991: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-06-18 21:03:47
1、首先应该分别优化形成氢键的双方，再拼在一起算氢键。不要把单个优化的问题带到大体系中。
2、b3lyp不能算弱相互作用，不能用来算氢键，但体系如此之大，要用DFT-D才有可能。DFT-D在G09 D版才有。
3、不要一开始就想算 freq，算完opt再说。 freq需要更大的计算量和存储空间。
4、拼接时优先考虑O。最好同时考虑多个。可以分别画出二者的静电势图帮助选择拼接点。
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丫丫兮兮1991
11楼2015-06-18 08:59:32
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zhou2009

版主 (著名写手)
要针对你的具体分子才能试摆。
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2楼2015-06-16 17:44:43
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kong890109

金虫 (小有名气)
gaussview 用刷子刷，用半经验方法先跑。
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3楼2015-06-16 22:13:19
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丫丫兮兮1991

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by kong890109 at 2015-06-16 22:13:19
gaussview 用刷子刷，用半经验方法先跑。

是在hyperchem里用半经验法优化嘛？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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4楼2015-06-16 22:33:42
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