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丫丫兮兮1991

新虫 (初入文坛)

[求助] 分子间氢键 已有1人参与

最近在算两个分子间氢键的键能,但在优化这两个分子体系的时候,老是出现L502错误,我觉得应该是这两个分子间的构型摆的不对,不知道大家有没有什么快速摆对分子构型的方法,急求呀!!!!!!
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
丫丫兮兮1991: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-06-18 21:03:47
1、首先应该分别优化形成氢键的双方,再拼在一起算氢键。不要把单个优化的问题带到大体系中。
2、b3lyp不能算弱相互作用,不能用来算氢键,但体系如此之大,要用DFT-D才有可能。DFT-D在G09 D版才有。
3、不要一开始就想算 freq,算完opt再说。 freq需要更大的计算量和存储空间。
4、拼接时优先考虑O。最好同时考虑多个。可以分别画出二者的静电势图帮助选择拼接点。

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11楼2015-06-18 08:59:32
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zhou2009

版主 (著名写手)

要针对你的具体分子才能试摆。
2楼2015-06-16 17:44:43
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kong890109

金虫 (小有名气)

gaussview 用刷子刷,用半经验方法先跑。
3楼2015-06-16 22:13:19
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丫丫兮兮1991

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by kong890109 at 2015-06-16 22:13:19
gaussview 用刷子刷,用半经验方法先跑。

是在hyperchem里用半经验法优化嘛?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2015-06-16 22:33:42
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