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分子间氢键 已有1人参与
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| 最近在算两个分子间氢键的键能,但在优化这两个分子体系的时候,老是出现L502错误,我觉得应该是这两个分子间的构型摆的不对,不知道大家有没有什么快速摆对分子构型的方法,急求呀!!!!!! |
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zhou2009
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【答案】应助回帖
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感谢参与,应助指数 +1
丫丫兮兮1991: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-06-18 21:03:47
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丫丫兮兮1991: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-06-18 21:03:47
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1、首先应该分别优化形成氢键的双方,再拼在一起算氢键。不要把单个优化的问题带到大体系中。 2、b3lyp不能算弱相互作用,不能用来算氢键,但体系如此之大,要用DFT-D才有可能。DFT-D在G09 D版才有。 3、不要一开始就想算 freq,算完opt再说。 freq需要更大的计算量和存储空间。 4、拼接时优先考虑O。最好同时考虑多个。可以分别画出二者的静电势图帮助选择拼接点。 |
11楼2015-06-18 08:59:32
zhou2009
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2楼2015-06-16 17:44:43
kong890109
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丫丫兮兮1991
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