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慧若星辰

铜虫 (正式写手)

[求助] 跪求大神帮忙解析晶体 已有2人参与

求帮忙解析附件里的晶体,压缩包是所用配方和初步解析的晶体数据。
      
        目前来看,晶体的主体骨架已经可以看出来,现在的主要问题是金属离子周围的羧基和吡啶环比较难以指认,而且无序的比较厉害。因个人水平有限,跪求大神帮忙解析,给予指导,万分感谢!跪求大神帮忙解析晶体
金属离子和有机配体.png
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慧若星辰,敏而好学
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wang#zheng

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容
感谢参与,应助指数 +1
这结构你以前求助过,结构很好,数据发我邮箱,我给你看看

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2015-06-16 20:16:48
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匿名

用户注销 (知名作家)

精修问题可私信


本帖仅楼主可见
4楼2015-06-16 21:18:51
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panperfect

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与,应助指数 +1
慧若星辰: 金币+100, ★★★很有帮助, 感谢应助!个人认为非常有帮助。如果能帮忙处理完,那就更好了。 2015-06-18 15:03:14
无序处理过了,看附件里的模型,很多溶剂分子我都用squeeze给删了。还有那个Br-热振动参数特别大,换成Cl-整体好些,如果你在反应过程或者培养晶体过程中使用CHCl3,CH2Cl2等溶剂,有可能会有Cl-出现在晶体结构中。你也做个SEM/EDX看一下。
还是不明白你为什么要用混合的配体去构建MOF,这样使整个分子都无序。用单纯一种可能会好些。
希望对你有帮助

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  • 2015-06-17 17:15:06, 940.12 K

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

7楼2015-06-17 17:20:22
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普通回帖

慧若星辰

铜虫 (正式写手)

谢谢应助。不知道您的邮箱多少?
慧若星辰,敏而好学
3楼2015-06-16 20:52:44
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慧若星辰

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lich666 at 2015-06-16 21:18:51
这个看着眼熟啊。。。那个环怎么没有插进去呢?上个还插进去了。

这次的求助贴跟上次的求助的那个是相同体系的,的确,结构解出来后大环是插进去了。因为上次数据质量不好,所以我又重做了样品,并重收了数据。这一次数据质量要好些,上次的Rint在0.13,这次的在0.046左右。但是结构无序还是很厉害,没办法,只好又来求助了。希望大神能帮忙再解解,看看怎么精修一下。多谢了!

[ 发自小木虫客户端 ]
慧若星辰,敏而好学
5楼2015-06-16 22:25:00
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慧若星辰

铜虫 (正式写手)

高手在何方?请多多帮忙应助啊~~
慧若星辰,敏而好学
6楼2015-06-17 15:54:49
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慧若星辰

铜虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by panperfect at 2015-06-17 17:20:22
无序处理过了,看附件里的模型,很多溶剂分子我都用squeeze给删了。还有那个Br-热振动参数特别大,换成Cl-整体好些,如果你在反应过程或者培养晶体过程中使用CHCl3,CH2Cl2等溶剂,有可能会有Cl-出现在晶体结构中。你 ...

非常感谢您的应助。做过了EDS检测,不过没有看到有Cl。

我试着处理过您给的数据结果,但是加氢有问题,不知道您能否帮忙把最后的精修(包括加氢、验证等)全部做完,帮忙给出个没有A类错误的CIF呢?谢谢~~本人刚入门不久,实在水平有限哪。
慧若星辰,敏而好学
8楼2015-06-17 18:31:56
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tzeshyang

铁杆木虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by panperfect at 2015-06-17 17:20:22
无序处理过了,看附件里的模型,很多溶剂分子我都用squeeze给删了。还有那个Br-热振动参数特别大,换成Cl-整体好些,如果你在反应过程或者培养晶体过程中使用CHCl3,CH2Cl2等溶剂,有可能会有Cl-出现在晶体结构中。你 ...

为何不用P1?
9楼2015-06-17 23:13:38
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慧若星辰

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by tzeshyang at 2015-06-17 23:13:38
为何不用P1?...

P1空间群是不是对称性用的太低了。阁下有何高见。
慧若星辰,敏而好学
10楼2015-06-18 15:01:59
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