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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
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Maker丶

铜虫 (初入文坛)

[交流] 关于diamond软件使用,加入原子?已有4人参与

求助大神:
   
        如何在diamond图中手动加入一个氢原子?(加入在与O原子相连的隧道结构中)
图1 为未加H原子的     图2 为加H原子的

怎么在图1 中手动加入H原子 然后画出图2的效果啊.....?


急求啊 !!!

关于diamond软件使用,加入原子?
图1.jpg


关于diamond软件使用,加入原子?-1
图2.jpg
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tobeamakernotadreamer
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calebby

捐助贵宾 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
diamond里面无法随意插入原子,必须要知道待插入的原子的坐标。你可以先把结构导入material studio,手动加上氢原子后,自动调整一下氢的位置。最后把结构导出为.res文件或.xyz文件,再用diamond打开,正常作图即可。
2楼2015-06-15 23:57:46
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木瓜少爷

至尊木虫 (文坛精英)

魔导师

二楼答案正解
3楼2015-06-16 00:23:20
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Maker丶

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by calebby at 2015-06-15 23:57:46
diamond里面无法随意插入原子,必须要知道待插入的原子的坐标。你可以先把结构导入material studio,手动加上氢原子后,自动调整一下氢的位置。最后把结构导出为.res文件或.xyz文件,再用diamond打开,正常作图即可。

非常感谢你的回答,但是我没用过material studio ,刚才试了一下,还是没有搞懂。想问下material studio是导入cif文件然后再手动加入氢原子还是导入其他的文件?或者能不能麻烦你帮我指导一下?下面附件为cif文件和diamond文件。
   
十分感谢!!

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  • 附件 1 : Buerger.cif
  • 2015-06-16 10:07:28, 1.03 K
  • 附件 2 : smk_burguer-1.diamdoc
  • 2015-06-16 10:07:29, 88.3 K
tobeamakernotadreamer
4楼2015-06-16 10:08:05
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Maker丶

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 木瓜少爷 at 2015-06-16 00:23:20
二楼答案正解

非常感谢,由于我没用过material studio,还是没有画出来。
tobeamakernotadreamer
5楼2015-06-16 10:10:01
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sunjunshan79

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
选中两个原子,在中间插入一个亚原子,定成氧就行
6楼2015-06-16 14:11:00
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zjh93Andy

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
选择两个原子或者一个环insert atom即可插入假原子

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
7楼2015-06-17 08:41:02
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