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新虫 (初入文坛)

[求助] LncRNA可以像编码基因一样计算PCC吗？生物意义一样吗？已有1人参与

如题，想利用LncRNA的某一个组织的表达谱数据，来构建LncRNA的类似PPI的相互作用网络，想用皮尔森线性相关系数来做，不知道可不可以，有没有生物依据。构建出来之后不知道和编码基因的PPI的生物意义是不是类似？
希望有大神解答，谢谢！万分感谢！
金币不多。。。

1楼 2015-06-11 16:40:53

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木虫 (正式写手)

五道杠

lncRNA的研究中，也表明lncRNA具有调控左右。既然是调控，那么就是有向的。一般情况下，分析lncRNA是计算共表达，利用PCC。但是，是计算lncRNA-mRNA的共表达情况。
因为，无论是lncRNA芯片还是lncRNA测序，都会包含mRNA的表达水平。

你，长大了吗？~有目的的希望小木虫不要倒闭

3楼2015-06-15 09:06:15

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