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缘华清

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
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虫号: 3386944
注册: 2014-08-28

[求助] LncRNA可以像编码基因一样计算PCC吗？生物意义一样吗？已有1人参与

如题，想利用LncRNA的某一个组织的表达谱数据，来构建LncRNA的类似PPI的相互作用网络，想用皮尔森线性相关系数来做，不知道可不可以，有没有生物依据。构建出来之后不知道和编码基因的PPI的生物意义是不是类似？
希望有大神解答，谢谢！万分感谢！
金币不多。。。

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1楼 2015-06-11 16:40:53

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠

应助: 24 (小学生)
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散金: 200
红花: 7
帖子: 789
在线: 170.7小时
虫号: 2070126
注册: 2012-10-18
性别: GG
专业: 生物信息学

【答案】应助回帖

lncRNA的研究中，也表明lncRNA具有调控左右。既然是调控，那么就是有向的。一般情况下，分析lncRNA是计算共表达，利用PCC。但是，是计算lncRNA-mRNA的共表达情况。
因为，无论是lncRNA芯片还是lncRNA测序，都会包含mRNA的表达水平。

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你，长大了吗？~有目的的希望小木虫不要倒闭

3楼2015-06-15 09:06:15