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缘华清

新虫 (初入文坛)

[求助] LncRNA可以像编码基因一样计算PCC吗?生物意义一样吗? 已有1人参与

如题,想利用LncRNA的某一个组织的表达谱数据,来构建LncRNA的类似PPI的相互作用网络,想用皮尔森线性相关系数来做,不知道可不可以,有没有生物依据。构建出来之后不知道和编码基因的PPI的生物意义是不是类似?
希望有大神解答,谢谢!万分感谢!
金币不多。。。
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缘华清

新虫 (初入文坛)

2楼2015-06-11 17:11:37
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xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠

【答案】应助回帖

lncRNA的研究中,也表明lncRNA具有调控左右。既然是调控,那么就是有向的。 一般情况下,分析lncRNA是计算共表达,利用PCC。但是,是计算lncRNA-mRNA的共表达情况。
因为,无论是lncRNA芯片还是lncRNA测序,都会包含mRNA的表达水平。
你,长大了吗?~有目的的希望小木虫不要倒闭
3楼2015-06-15 09:06:15
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