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devilpanda

金虫 (小有名气)

[求助] 放线菌次级代谢产物关于选择合适氘代试剂进行 NMR分析的问题 已有1人参与

背景:
从放线菌放线菌2号培养基15L中分离到了12个产物,6个来自菌体丙酮提取物,6个来自乙酸乙酯发酵液提取物,HPLC-UV(254nm)检测下,甲醇-水体系,90水到0水,30分钟,化合物主要在5-15分钟出峰,代表化合物的极性是中大极性的,均是黄色无定型粉末和白色粉末,居然木有结晶,这对我这种小菜来说,简直忧伤,说好的雪花呢?
问题1:
使用了氘代水,甲醇,氯仿,丙酮,乙酸乙酯,均不能溶解,后面几个15-25分钟出峰的,能够用氘代甲醇溶解,因为现在实验室没有人做天然产物,对于结构解析一窍不通,老板略忙,上小木虫求教一下大神们,我想问,这个现象很正常嘛?
问题2
实在不行,想用DMSO溶解了,如果打出来的谱图不行,冷冻干燥是不是可以去除DMSO,对冷冻干燥机有影响吗?(冷冻干燥机不能进有机试剂啥的)如果有,应该怎么办呢?
问题3
大家在分放线菌天然产物的时候,菌体内含的物质分出来的化合物,有可能是具有生物活性的化合物吗?文献看了几篇应该是分泌到胞外的化合物活性比较好,那为什么大家都还是把菌体的丙酮提取物用来分离呢?
问题4
关于样品验纯,从制备柱直接接下来的,液相分析后,在254nm下已经没有杂质,其他波长没试过,只能说感觉上纯了,响应值比较高的时候(400-500)会有响应值10左右的小杂峰,峰面积比的话因为基线有点飘,所以看不大出来,不过不漂的基线算了一下,纯度在90左右,那么,这样的情况可以用去打核磁了吗?
问题5
万念俱灰地因为实验不那么顺利,一直在纠结,分离到的化合物该不会是发酵培养基里面的东西吧,因为结构不知道啊,所以忧伤中(放线菌2号作为培养基),有没有大神真的做过对于放线菌2号培养基物质的鉴定的呀!
问题6
分到的化合物,因为这么多可能,我也不清楚自己样品是否纯,想看看他们的分子量,做质谱,我怕自己的样品不那么纯,所以,可以用LC-MS来确定分子量吗?(就是把所有的化合物取一部分出来,做成一个样,然后,用这个混合样直接去打LC-MS)。
好了问题还有,真的快被这实验虐得不要不要的了,求大神帮忙啊,让我在漫长的黑夜能够睡一会儿,有同样遭遇的,能不能给我点经验呢!!??还有啊,
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zhuhucheng

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
devilpanda: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 谢谢大侠 2015-06-11 23:41:59
devilpanda: 金币+90, ★★★★★最佳答案 2015-06-11 23:43:12
1.正常。什么氘代试剂好溶就用什么溶。
2.DMSO可以冷冻干燥,问题不大。不过用DMSO之前可以试试氘代吡啶(黄色的样品应该有大共轭基团,可能吡啶溶剂峰会掩盖化合物里面烯碳,慎用)
3.活性不好说。文献说分泌到外面的有活性也没有说里面的没有活性吧
4.先测氢谱看看纯度再说
5.不清楚培养基组成。不过不要万念俱灰,总会经历这么个痛苦的过程的
6.混合样没有意义的吧。氢谱看看纯度就好了,可以的话再做碳谱和DEPT
7.问题呢?
甲醇能溶的做谱了没有?赶快去溶解样品做核磁吧
另外,样品不要放太久,怕不稳定。不清楚情况前尽量避光冷藏。。。
4楼2015-06-10 20:08:28
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devilpanda

金虫 (小有名气)

大神们别匿啦,速度解救我啊!!!!!
2楼2015-06-09 21:22:38
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devilpanda

金虫 (小有名气)

有没有大神速度来啊。。。。。
3楼2015-06-09 22:35:17
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zhuhucheng

木虫 (正式写手)

才看到是100个金币,下血本了,有诚意
赠送解谱一个
5楼2015-06-10 20:10:59
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