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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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devilpanda

金虫 (小有名气)

[求助] 放线菌次级代谢产物关于选择合适氘代试剂进行 NMR分析的问题 已有1人参与

背景:
从放线菌放线菌2号培养基15L中分离到了12个产物,6个来自菌体丙酮提取物,6个来自乙酸乙酯发酵液提取物,HPLC-UV(254nm)检测下,甲醇-水体系,90水到0水,30分钟,化合物主要在5-15分钟出峰,代表化合物的极性是中大极性的,均是黄色无定型粉末和白色粉末,居然木有结晶,这对我这种小菜来说,简直忧伤,说好的雪花呢?
问题1:
使用了氘代水,甲醇,氯仿,丙酮,乙酸乙酯,均不能溶解,后面几个15-25分钟出峰的,能够用氘代甲醇溶解,因为现在实验室没有人做天然产物,对于结构解析一窍不通,老板略忙,上小木虫求教一下大神们,我想问,这个现象很正常嘛?
问题2
实在不行,想用DMSO溶解了,如果打出来的谱图不行,冷冻干燥是不是可以去除DMSO,对冷冻干燥机有影响吗?(冷冻干燥机不能进有机试剂啥的)如果有,应该怎么办呢?
问题3
大家在分放线菌天然产物的时候,菌体内含的物质分出来的化合物,有可能是具有生物活性的化合物吗?文献看了几篇应该是分泌到胞外的化合物活性比较好,那为什么大家都还是把菌体的丙酮提取物用来分离呢?
问题4
关于样品验纯,从制备柱直接接下来的,液相分析后,在254nm下已经没有杂质,其他波长没试过,只能说感觉上纯了,响应值比较高的时候(400-500)会有响应值10左右的小杂峰,峰面积比的话因为基线有点飘,所以看不大出来,不过不漂的基线算了一下,纯度在90左右,那么,这样的情况可以用去打核磁了吗?
问题5
万念俱灰地因为实验不那么顺利,一直在纠结,分离到的化合物该不会是发酵培养基里面的东西吧,因为结构不知道啊,所以忧伤中(放线菌2号作为培养基),有没有大神真的做过对于放线菌2号培养基物质的鉴定的呀!
问题6
分到的化合物,因为这么多可能,我也不清楚自己样品是否纯,想看看他们的分子量,做质谱,我怕自己的样品不那么纯,所以,可以用LC-MS来确定分子量吗?(就是把所有的化合物取一部分出来,做成一个样,然后,用这个混合样直接去打LC-MS)。
好了问题还有,真的快被这实验虐得不要不要的了,求大神帮忙啊,让我在漫长的黑夜能够睡一会儿,有同样遭遇的,能不能给我点经验呢!!??还有啊,
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devilpanda

金虫 (小有名气)

大神们别匿啦,速度解救我啊!!!!!
2楼2015-06-09 21:22:38
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devilpanda

金虫 (小有名气)

有没有大神速度来啊。。。。。
3楼2015-06-09 22:35:17
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zhuhucheng

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与,应助指数 +1
devilpanda: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 谢谢大侠 2015-06-11 23:41:59
devilpanda: 金币+90, ★★★★★最佳答案 2015-06-11 23:43:12
1.正常。什么氘代试剂好溶就用什么溶。
2.DMSO可以冷冻干燥,问题不大。不过用DMSO之前可以试试氘代吡啶(黄色的样品应该有大共轭基团,可能吡啶溶剂峰会掩盖化合物里面烯碳,慎用)
3.活性不好说。文献说分泌到外面的有活性也没有说里面的没有活性吧
4.先测氢谱看看纯度再说
5.不清楚培养基组成。不过不要万念俱灰,总会经历这么个痛苦的过程的
6.混合样没有意义的吧。氢谱看看纯度就好了,可以的话再做碳谱和DEPT
7.问题呢?
甲醇能溶的做谱了没有?赶快去溶解样品做核磁吧
另外,样品不要放太久,怕不稳定。不清楚情况前尽量避光冷藏。。。
4楼2015-06-10 20:08:28
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zhuhucheng

木虫 (正式写手)

才看到是100个金币,下血本了,有诚意
赠送解谱一个
5楼2015-06-10 20:10:59
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devilpanda

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by zhuhucheng at 2015-06-10 20:10:59
才看到是100个金币,下血本了,有诚意
赠送解谱一个

额。。。怎么把100个给你???上面的那10个只是单纯给大侠回答问题的分数额
6楼2015-06-11 23:42:38
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devilpanda

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by zhuhucheng at 2015-06-10 20:10:59
才看到是100个金币,下血本了,有诚意
赠送解谱一个

只是打了H谱。。。。。。。貌似不好解。。。。。等碳谱数据出来,求大侠赐教啊
7楼2015-06-11 23:44:25
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devilpanda

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by zhuhucheng at 2015-06-10 20:10:59
才看到是100个金币,下血本了,有诚意
赠送解谱一个

问题1
氢谱打了甲醇能够溶解的两个样,很相似,可能是一系列的,如何能够从H谱看出样品的纯不纯呢?看有没有毛刺吗?真的不懂

PS:老板看了说是不那么纯,不过纯度应该还行,因为只是疑惑的问了我一下是不是不那么纯呀,然后要我去查这个菌产生的物质再看看。。大侠能不能给QQ啊???
8楼2015-06-11 23:51:16
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devilpanda

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zhuhucheng at 2015-06-10 20:08:28
1.正常。什么氘代试剂好溶就用什么溶。
2.DMSO可以冷冻干燥,问题不大。不过用DMSO之前可以试试氘代吡啶(黄色的样品应该有大共轭基团,可能吡啶溶剂峰会掩盖化合物里面烯碳,慎用)
3.活性不好说。文献说分泌到外 ...

大神,你的QQ居然找不到了,能不能加我下呢?1158285749
9楼2015-06-15 20:17:05
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wanqing0211

新虫 (初入文坛)


问题1:建议用ACD/Labs解谱,功能强大;
问题2:别想着用冻干机冻走DMSO,冻走它简直是痴人说梦,建议水稀释后萃取;
问题4:建议重结晶一下,或者爬TLC;
问题5:紫外的峰面积积分说明不了纯度,因为各个化合物的吸收强度不同;
问题6:LCMS可以确定分子量,但是你得到的分子量有可能是原始分子的一个碎片的分子量,ACD/Labs可以帮你得到化合物裂解途径报告。小部分化合物建议用乙腈或者甲醇溶解,逐个打LCMS(千万不要混合,混合了就做不到一一对应了)。
如果再有问题,可以去7月3日上午在北京大学天然药物及仿生药物国家重点实验室了解关于结构确认的具体内容。
10楼2015-06-30 16:12:42
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