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至尊木虫 (正式写手)

[交流] 30个金币求助:如何消除一下A,c,G级错误?谢谢!

做了个单晶,cif检查出现以下错误,请问该怎样修正呀,我刚接触这门学科,很多东西都不懂,望高手不吝赐教 ,万分感谢!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!

Alert level A
PLAT112_ALERT_2_A ADDSYM Detects Additional (Pseudo) Symm. Elem...          2     
PLAT112_ALERT_2_A ADDSYM Detects Additional (Pseudo) Symm. Elem...          2     
PLAT113_ALERT_2_A ADDSYM Suggests Possible Pseudo/New Space-group.    P212121     
PLAT035_ALERT_1_A No _chemical_absolute_configuration info given .          ?
Alert level C
PLAT029_ALERT_3_C _diffrn_measured_fraction_theta_full Low .......       0.97      
PLAT340_ALERT_3_C Low Bond Precision on C-C Bonds (x 1000) Ang ...          6      
PLAT420_ALERT_2_C D-H Without Acceptor       N4     -   H4N    ...          ?      
PLAT420_ALERT_2_C D-H Without Acceptor       N8     -   H8N    ...          ?      
PLAT041_ALERT_1_C Calc. and Rep. SumFormula Strings    Differ ....          ?
PLAT042_ALERT_1_C Calc. and Rep. MoietyFormula Strings Differ ....          ?
PLAT045_ALERT_1_C Calculated and Reported Z Differ by ............       2.00 Ratio
PLAT194_ALERT_1_C Missing _cell_measurement_reflns_used datum ....          ?
PLAT195_ALERT_1_C Missing _cell_measurement_theta_max   datum ....          ?
PLAT196_ALERT_1_C Missing _cell_measurement_theta_min   datum ....          ?
Alert level G
REFLT03_ALERT_4_G Please check that the estimate of the number of Friedel pairs is
            correct. If it is not, please give the correct count in the
            _publ_section_exptl_refinement section of the submitted CIF.
           From the CIF: _diffrn_reflns_theta_max           25.03
           From the CIF: _reflns_number_total               6605
           Count of symmetry unique reflns         3697
           Completeness (_total/calc)            178.66%
           TEST3: Check Friedels for noncentro structure
           Estimate of Friedel pairs measured      2908
           Fraction of Friedel pairs measured     0.787
           Are heavy atom types Z>Si present        yes
PLAT791_ALERT_4_G Confirm the Absolute Configuration of C10    ...          R      
PLAT791_ALERT_4_G Confirm the Absolute Configuration of C30    ...          R
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

一般的C和G可以不用修改的吧
A里面是不是提示你空间群有问题啊~~好好用platon检查下
其他的应该是有的没有填
2楼2008-07-23 20:00:31
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

这个文件是cif的各项说明 你可以对照看看 能改的自己看下先

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
patent(金币+10,VIP+0):谢谢!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!1111
3楼2008-07-23 20:03:27
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wangxiuhang

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
patent(金币+5,VIP+0):谢谢牛人,能否详细说下呀
空间群错误,装个platon转化空间群,重新修一下。修一轮之后看看.lst文件,如果z只有问题改一下,各原子个数如有问题.lst文件中会有提示,改成提示的数值,在修一轮就ok了
4楼2008-07-24 09:34:22
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patent

至尊木虫 (正式写手)

谢谢wangxiuhang
platon怎样修呀,我不会用它
能否详细说下呀
成分感谢!!!!!!!!!!!!
5楼2008-07-24 10:28:35
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zhmiao119

木虫 (著名写手)

安装PLATON软件,打开res文件,输入calc missym指令后看结果,有没有提示空间群的问题即可!
6楼2008-07-24 16:26:34
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patent

至尊木虫 (正式写手)

楼上的各位朋友
能否详细说下呀,或者贴个图呀
我还是修不了呀
谢谢!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
7楼2008-07-25 07:35:09
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