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foradun

[交流] 【求助】gromacs的一个小问题

gromacs生成的.gro文件的末尾一行有三个保留到小数点后5位的值,请问下这三个值代表什么意思,我将两个.gro文件合并成一个时,需要保留这一行吗?或是需要修改这一行吗?
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panda_wendao

金虫 (小有名气)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
这个是盒子的大小,需要有,但并不是要保留而应该根据实际情况计算,另外合并两个gro文件并不能直接进行,序号需要相应调整,所以要借助工具比如genconf,genbox命令。
网上还有些小工具可以做
2楼2008-07-22 22:31:30
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foradun

非常感谢,我把两个gro在编辑器中合成一个的时候,如果保留这三个数值,会提示XX序号原子错误,所以不知道去掉后会不会有影响,非常感谢。
3楼2008-07-23 14:09:32
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panda_wendao

金虫 (小有名气)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
合并之后用editconf重新输出一下会得到合适的盒子尺寸
4楼2008-07-23 15:45:26
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foradun

引用回帖:
Originally posted by panda_wendao at 2008-7-23 15:45:
合并之后用editconf重新输出一下会得到合适的盒子尺寸

非常感谢,谢谢小木虫的大侠们。
5楼2008-07-23 17:32:44
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