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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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sumwindy

金虫 (正式写手)

[求助] 求助一个无序氰基的处理 已有2人参与

结构中有一个氰基无序:独立单元中只有一个原子A,对称操作后可以产生A-A键,且键长为1.1埃左右,故指派为氰基:
精修时使用如下命令:
EXYZ C1 N1
EADP C1 N1
同时调整C1 和N1的占有率为50%。
问题是在chekcif时出现A级错误: Short Inter D...A Contact  N1    ..  N1 1.14埃?
请问各位大神如何处理这样的问题?
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匿名

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精修问题可私信


★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
sumwindy: 金币+5, 有帮助, 虽然大神的方法并没有起作用,但是还是要谢谢你! 2015-05-29 15:33:43
本帖仅楼主可见
2楼2015-05-28 18:17:17
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你确定是氰基吗,氰基是不对称结构,还能产生对称无序?
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
3楼2015-05-28 19:25:04
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sumwindy

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 我想更懂你29 at 2015-05-28 19:25:04
你确定是氰基吗,氰基是不对称结构,还能产生对称无序?

确定是氰基
4楼2015-05-29 15:34:02
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sumwindy

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lich666 at 2015-05-28 18:17:17
成键连通性问题,加上命令free N1 N1_$1,EQIV $1 距离近的N1的对照操作码。

经过尝试,最终使用part -1指令精修完成
5楼2015-05-29 15:35:02
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sumwindy

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by sumwindy at 2015-05-29 15:35:02
经过尝试,最终使用part -1指令精修完成...

求助完成,请版主封贴
6楼2015-05-29 15:36:47
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