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wyqzl

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[求助] 求大神，同源性的高低与家族蛋白的区别已有1人参与

经过blast某基因得到一些同源性序列，那么这些同源性序列所对应的蛋白是否具有同源性？这些同源性序列对应的蛋白是否是该基因的家族蛋白

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1楼 2015-05-22 16:59:26

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liuderong

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【答案】应助回帖

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wyqzl: 金币+2, ★有帮助 2015-05-24 11:08:56

blast比对的是序列相似性，而不是同源性。一般情况下，相似性高的蛋白都是同源的，但这只是一般的规律，而不是定论，所以也不否认有部分相似性高但又不是同源蛋白的蛋白，虽然我举不出例子。
基因家族通常是根据功能来分类的，所以更多是看结构域，具有某个结构域的一组蛋白，相似性可能不高但往往也会归为同一家族。
其实相似性和同源性的区分界限不是很明显，很多情况下还会混着使用。我个人觉得，无论是从那个方面论述，只要作者能自圆其说，那就是正确的，没有必要区分是不是真正的“同源”或“相似”。

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