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wyqzl

新虫 (初入文坛)

[求助] 求大神,同源性的高低与家族蛋白的区别 已有1人参与

经过blast某基因得到一些同源性序列,那么这些同源性序列所对应的蛋白是否具有同源性?这些同源性序列对应的蛋白是否是该基因的家族蛋白
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wyqzl: 金币+2, ★有帮助 2015-05-24 11:08:56
blast比对的是序列相似性,而不是同源性。一般情况下,相似性高的蛋白都是同源的,但这只是一般的规律,而不是定论,所以也不否认有部分相似性高但又不是同源蛋白的蛋白,虽然我举不出例子。
基因家族通常是根据功能来分类的,所以更多是看结构域,具有某个结构域的一组蛋白,相似性可能不高但往往也会归为同一家族。
其实相似性和同源性的区分界限不是很明显,很多情况下还会混着使用。我个人觉得,无论是从那个方面论述,只要作者能自圆其说,那就是正确的,没有必要区分是不是真正的“同源”或“相似”。
2楼2015-05-23 08:54:09
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